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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助成功】exit status of rank 5: killed by signal 9 错误？？？？
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟

[交流] 【求助成功】exit status of rank 5: killed by signal 9 错误？？？？ 已有3人参与

VASP做磁性材料的结构优化，30原子的原胞，计算老是中止，显示错误信息
exit status of rank 5: killed by signal 9，采用IBRION=2 , ISMEAR =0;SIGMA=0.2, POTIM=0.1, DAV,请问可能哪里出问题了，谢谢大家



[ Last edited by zzy870720z on 2011-4-25 at 17:11 ]
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1楼 2010-05-10 08:48:46
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

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以前遇到过，不太清楚是怎么回事？应该和机器或者设置有关系
提高精度试试行不行？有时候重启就好了
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-05-10 08:56:44
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-05-10 08:56:44:
以前遇到过，不太清楚是怎么回事？应该和机器或者设置有关系
提高精度试试行不行？有时候重启就好了

我个人认为是设置问题，但最近看手册（没看懂），也一直在改参数，就是解决不了问题，我已经降低到EDIFF=1E-3 EDIFFG= -0.01，在设置上你有哪些建议，谢谢你
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3楼2010-05-10 09:11:14
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zzy870720z

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calos818(金币+1): 2010-05-10 09:21:54
你做离子驰豫，那把input贴出来大家讨论下吧
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
4楼2010-05-10 09:20:27
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-05-10 09:20:27:
你做离子驰豫，那把input贴出来大家讨论下吧

SYSTEM=relax
PREC=Medium
ISMEAR =0;SIGMA=0.2
ISPIN=2
ISIF=3
ISTART=0
ICHARG=2
EDIFF=1E-3
EDIFFG=-0.01
LREAL=Auto
LCHARG=F
LWAVE=F
IBRION=2
POTIM=0.1
#LMAXMIX = 2
#AMIX = 0.2
#BMIX = 0.0001
#AMIX_MAG = 0.8
GGA=PE
#ALGO=VeryFast  ! equals to IALGO=48
PSTRESS=50
NELM=200
NSW=200
MAGMOM=0 0 0 0 0 0 5 -5  5 -5  5  -5 18*0
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5楼2010-05-10 09:22:25
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-05-10 09:20:27:
你做离子驰豫，那把input贴出来大家讨论下吧

已经给出，麻烦帮我看下问题出在哪里
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6楼2010-05-10 09:32:19
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

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看不错来有什么错误，呵呵，跑过这个，lz试试
没有外压的

SYSTEM=Fe
PREC=Medium
ISTART = 0
   ISPIN  = 2
   ISYM   = 0
   GGA    = 91
   ISIF   = 3
   ALGO   = FAST
   NELM   = 100
   EDIFF  = 1E-4
   EDIFFG = 0.001
   LREAL  = .REAL.
   NSW    = 500
   IBRION = 2
   ISMEAR =  1
   SIGMA  = 0.1
   NWRITE = 2
   LWAVE  = .FALSE.
   LCHARG = .FALSE.
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
7楼2010-05-10 09:40:14
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-05-10 09:40:14:
看不错来有什么错误，呵呵，跑过这个，lz试试
没有外压的

SYSTEM=Fe
PREC=Medium
ISTART = 0
   ISPIN  = 2
   ISYM   = 0
   GGA    = 91
   ISIF   = 3
   ALGO   = FAST
   NELM   = 100
   EDI ...

谢谢，我现在想加上压力，请问可以吗
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8楼2010-05-10 09:59:11
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

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试试吧，我没加过，看看会怎么样？
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
9楼2010-05-10 10:02:35
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nkleof

银虫 (正式写手)
calos818(金币+1): 2010-05-13 10:09:55
引用回帖:
Originally posted by calos818 at 2010-05-10 08:48:46:
VASP做磁性材料的结构优化，30原子的原胞，计算老是中止，显示错误信息
exit status of rank 5: killed by signal 9，采用IBRION=2 , ISMEAR =0;SIGMA=0.2, POTIM=0.1, DAV,请问可能哪里出问题了，谢谢大家

这种情况怀疑可能是超出内存太多造成的，以前我遇到过相同的错误。你用makeparam查看一下任务需要的内存是多大。
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10楼2010-05-13 10:07:03
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