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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】运行transiesta时候出现的一个问题
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yashumimi

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】运行transiesta时候出现的一个问题 已有2人参与

我运行transiesta时候出现的问题   并且发现电压设置小于0.01V，就会出现如下问题。电压增加后又正常了。。。

Got RIGHT  Electrode GF
Done
L-ELEC: lastoL:            0           9          18          27          36
          45          54          58          62
R-ELEC: lastoR:            0           9          18          27          36
          45          54          58          62
TRANSIESTA: Initializing lists
From SIESTA: Efermi=  -5.742
qc0 :   0.000
qcn0 : 104.993
nou,NGL,NGR:         248          62          62
rank 0 in job 1  ws_48120   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 0: killed by signal 9

tbtrans运行没有问题。。。请问有没有谁碰到过这种问题？ 这是什么情况阿？

[ Last edited by yashumimi on 2011-3-7 at 15:51 ]
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1楼 2011-03-07 15:10:35
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhang668(金币+1): 多谢提示 2011-03-08 09:56:23
引用回帖:
Originally posted by yashumimi at 2011-03-07 08:10:35:
我运行transiesta时候出现的问题   并且发现电压设置小于0.01V，就会出现如下问题。电压增加后又正常了。。。

Got RIGHT  Electrode GF
Done
L-ELEC: lastoL:            0           9          18      ...

不要设置的偏压太小。太小了，可能偏压部分的积分出现了奇点。我这个也是猜测。因为之前有人遇到这个问题了。你可以翻看一下以前的帖子。
赞一下(2人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
2楼2011-03-07 21:10:29
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yashumimi

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-03-07 21:10:29:
不要设置的偏压太小。太小了，可能偏压部分的积分出现了奇点。我这个也是猜测。因为之前有人遇到这个问题了。你可以翻看一下以前的帖子。

谢谢关注^ ^

因为5，6个文件都出现这个问题 所以在想是电压设置的问题 然后更细分了下 结果发现小于0.01eV都计算不下去

我刚刚在siesta－l 里问了下
早些前的邮件看不了

有人回答的话我就贴上来
赞一下 回复此楼
3楼2011-03-07 21:26:25
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yashumimi

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-03-07 21:10:29:
不要设置的偏压太小。太小了，可能偏压部分的积分出现了奇点。我这个也是猜测。因为之前有人遇到这个问题了。你可以翻看一下以前的帖子。

看到这个帖子了
汗
汗
我当时没注意
结果还是重复错误了
结果连解决方法都一样
汗
赞一下 回复此楼
4楼2011-03-07 21:40:20
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zhang668(金币+2): 多谢提示 2011-03-08 09:56:52
引用回帖:
Originally posted by yashumimi at 2011-03-07 14:26:25:
谢谢关注^ ^

因为5，6个文件都出现这个问题 所以在想是电压设置的问题 然后更细分了下 结果发现小于0.01eV都计算不下去

我刚刚在siesta－l 里问了下
早些前的邮件看不了

有人回答的话我就贴上来

你的这个问题，前一个人已经问过了，并且没有回复（http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2657240）。我想你这个问题是Transiesta的一个bug或者说一个不适用的地方。我想这个问题是一个bug.数值计算中的一个bug,可能开发者看到你的帖子会注意这个问题的。

[ Last edited by zhangguangping on 2011-3-8 at 02:45 ]
赞一下(2人) 回复此楼
弘德明志博学笃行
5楼2011-03-08 09:42:11
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