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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » No initial positions read in
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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

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[求助] No initial positions read in

这段时间自学VASP,跑过几个例子，今天照着例子，用自己的体系创建四个输入文件，跑一遍报错 No initial positions read in，论坛搜索了下，说是POSCAR文件有问题，然后改过几次，还是那个报错，现在贴上来给各位看看，初学不懂，欢迎拍砖！
直接帖不上来，超过字符限制了！见附件吧！四个文件都传上来了，还请斧正！

[ Last edited by gmy1990 on 2011-5-23 at 20:06 ]
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1楼 2011-05-23 16:33:24
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

utdwang

银虫 (初入文坛)
★
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-09-09 15:52:25
delete the space before 'selective dyanmics' and 'direct'.
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Thekeytosuccessinnearlyeverythingisdailyaction
21楼2011-09-09 07:55:31
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
gmy1990(金币+3): 谢谢，这样我也跑过，但还是报那个错. 2011-05-23 20:04:02
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:32:39
改成这样
ZnBPP-PE
  1
5.664000000000000      -5.664000000000000     -14.228999999999999
0.000000000000000      22.655999999999999       0.000000000000000
23.334319923239100       0.000000000000000       9.288466374673281
H  C N  O  Ti Zn
24 41 4 128 72  1
selective   Dynamics
Cartesian
0.578361   0.718614   0.611128   T T T
0.547221   0.632501   0.531675   T T T
0.682425   0.725486   0.811705   T T T
0.706360   0.639600   0.879079   T T T
0.692803   0.521882   0.870106   T T T
0.681308   0.404317   0.865591   T T T
......
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心之所向无惧无悔
5楼2011-05-23 19:40:28
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blablablu

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
23楼: Originally posted by 用户名zxj at 2015-06-16 16:47:58
同问，解决办法，感谢分享！

delete the space before 'selective dyanmics' and 'direct'.
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25楼2016-02-13 20:44:22
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普通回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
gmy1990(金币+2): 谢谢，这样试过，还是不行。 2011-05-23 20:03:28
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:31:57
引用回帖:
Originally posted by gmy1990 at 2011-05-23 16:33:24:
这段时间自学VASP,跑过几个例子，今天照着例子，用自己的体系创建四个输入文件，跑一遍报错 No initial positions read in，论坛搜索了下，说是POSCAR文件有问题，然后改过几次，还是那个报错，现在贴上来给各位看 ...

gmy1990 , 不能直接把MS的坐标copy过来，要把元素符号除掉，还有那个1，2 。。也要去掉，只留下坐标。。试试
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timeflies..
2楼2011-05-23 16:54:56
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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
引用回帖:
Originally posted by enola at 2011-05-23 16:54:56:
gmy1990 , 不能直接把MS的坐标copy过来，要把元素符号除掉，还有那个1，2 。。也要去掉，只留下坐标。。试试

我试过的呀，附件里的是我最后一次尝试的POSCAR文件，我用滴是vasp5.2，看到有地方说要加元素符号，就.....照你说的试过，还是报那个错.
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3楼2011-05-23 17:08:38
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:32:18
gmy1990(金币+1): 谢谢！ 2011-05-24 12:55:11
gmy1990(金币+1): 谢谢！ 2011-05-24 14:31:51
vasp5.2不需要加元素符号，加上也可以，不加直接用4.6的也没问题，关键是你加的地方不对，元素符号家在晶胞参数后面那一行，而不是原子坐标前面
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心之所向无惧无悔
4楼2011-05-23 19:38:47
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

gmy1990(金币+1): 谢谢！ 2011-05-23 20:05:07
应该是元素符号的位置不对，应该在后面，如果做动力学的话，试一试siesta
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6楼2011-05-23 19:43:48
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
gmy1990(金币+3): 这样做过了，还是不行的，谢谢！ 2011-05-23 21:10:00
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:33:00
应该是你复制过来里面有很多非unix的字符 你dos2unix一下，或者复制出来，然后再txt中黏贴在复制出来也行
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
7楼2011-05-23 20:47:36
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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

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引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-05-23 19:40:28:
改成这样
ZnBPP-PE
  1
5.664000000000000      -5.664000000000000     -14.228999999999999
0.000000000000000      22.655999999999999       0.000000000000000
23.334319923239100       0.0000000 ...

这样跑过，都还是那个报错，我现在把四个文件都附上，还请纠错！谢谢！
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8楼2011-05-23 21:12:51
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gmy1990

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引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-05-23 20:47:36:
应该是你复制过来里面有很多非unix的字符 你dos2unix一下，或者复制出来，然后再txt中黏贴在复制出来也行

我把报错信息都弄全粘上来吧，

running on    8 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    8 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  6 types and  270 ions

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|  ADVICE TO THIS USER RUNNING 'VASP/VAMP'   (HEAR YOUR MASTER'S VOICE ...):  |
|                                                                             |
|      You have a (more or less) 'large supercell' and for larger cells       |
|      it might be more efficient to use real space projection operators      |
|      So try LREAL= Auto  in the INCAR   file.                               |
|      Mind: If you want to do a very accurate calculations keep the          |
|      reciprocal projection scheme          (i.e. LREAL=.FALSE.)             |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

  No initial positions read in
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9楼2011-05-23 21:17:54
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
gmy1990(金币+3): 现在发现POSCAR的问题了，每行都得顶格写，不能有空格，这个有点....跑了下，又有新的报错，贴在后面，还请指教！ 2011-05-23 22:49:52
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-09-09 18:20:51
dos2unix POSCAR
试一试
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
10楼2011-05-23 21:49:13
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