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gmy1990

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[求助] No initial positions read in

这段时间自学VASP,跑过几个例子,今天照着例子,用自己的体系创建四个输入文件,跑一遍报错 No initial positions read in,论坛搜索了下,说是POSCAR文件有问题,然后改过几次,还是那个报错,现在贴上来给各位看看,初学不懂,欢迎拍砖!
直接帖不上来,超过字符限制了!见附件吧!四个文件都传上来了,还请斧正!

[ Last edited by gmy1990 on 2011-5-23 at 20:06 ]
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utdwang

银虫 (初入文坛)


gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-09-09 15:52:25
delete the space before 'selective dyanmics' and 'direct'.
Thekeytosuccessinnearlyeverythingisdailyaction
21楼2011-09-09 07:55:31
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


gmy1990(金币+3): 谢谢,这样我也跑过,但还是报那个错. 2011-05-23 20:04:02
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:32:39
改成这样
ZnBPP-PE
  1
5.664000000000000      -5.664000000000000     -14.228999999999999
0.000000000000000      22.655999999999999       0.000000000000000
23.334319923239100       0.000000000000000       9.288466374673281
H  C N  O  Ti Zn
24 41 4 128 72  1
selective   Dynamics
Cartesian
0.578361   0.718614   0.611128   T T T
0.547221   0.632501   0.531675   T T T
0.682425   0.725486   0.811705   T T T
0.706360   0.639600   0.879079   T T T
0.692803   0.521882   0.870106   T T T
0.681308   0.404317   0.865591   T T T
......
心之所向无惧无悔
5楼2011-05-23 19:40:28
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blablablu

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
23楼: Originally posted by 用户名zxj at 2015-06-16 16:47:58
同问,解决办法,感谢分享!

delete the space before 'selective dyanmics' and 'direct'.
25楼2016-02-13 20:44:22
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普通回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖


gmy1990(金币+2): 谢谢,这样试过,还是不行。 2011-05-23 20:03:28
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:31:57
引用回帖:
Originally posted by gmy1990 at 2011-05-23 16:33:24:
这段时间自学VASP,跑过几个例子,今天照着例子,用自己的体系创建四个输入文件,跑一遍报错 No initial positions read in,论坛搜索了下,说是POSCAR文件有问题,然后改过几次,还是那个报错,现在贴上来给各位看 ...

gmy1990 , 不能直接把MS的坐标copy过来,要把元素符号除掉,还有那个1,2 。。也要去掉,只留下坐标。。试试
timeflies..
2楼2011-05-23 16:54:56
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gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
Originally posted by enola at 2011-05-23 16:54:56:
gmy1990 , 不能直接把MS的坐标copy过来,要把元素符号除掉,还有那个1,2 。。也要去掉,只留下坐标。。试试

我试过的呀,附件里的是我最后一次尝试的POSCAR文件,我用滴是vasp5.2,看到有地方说要加元素符号,就.....照你说的试过,还是报那个错.
3楼2011-05-23 17:08:38
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:32:18
gmy1990(金币+1): 谢谢! 2011-05-24 12:55:11
gmy1990(金币+1): 谢谢! 2011-05-24 14:31:51
vasp5.2不需要加元素符号,加上也可以,不加直接用4.6的也没问题,关键是你加的地方不对,元素符号家在晶胞参数后面那一行,而不是原子坐标前面
心之所向无惧无悔
4楼2011-05-23 19:38:47
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

gmy1990(金币+1): 谢谢! 2011-05-23 20:05:07
应该是元素符号的位置不对,应该在后面,如果做动力学的话,试一试siesta
6楼2011-05-23 19:43:48
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


gmy1990(金币+3): 这样做过了,还是不行的,谢谢! 2011-05-23 21:10:00
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:33:00
应该是你复制过来里面有很多非unix的字符 你dos2unix一下,或者复制出来,然后再txt中黏贴在复制出来也行
嘟啦啦嘟啦啦嘟
7楼2011-05-23 20:47:36
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gmy1990

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引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-05-23 19:40:28:
改成这样
ZnBPP-PE
  1
5.664000000000000      -5.664000000000000     -14.228999999999999
0.000000000000000      22.655999999999999       0.000000000000000
23.334319923239100       0.0000000 ...

这样跑过,都还是那个报错,我现在把四个文件都附上,还请纠错!谢谢!
8楼2011-05-23 21:12:51
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gmy1990

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引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-05-23 20:47:36:
应该是你复制过来里面有很多非unix的字符 你dos2unix一下,或者复制出来,然后再txt中黏贴在复制出来也行

我把报错信息都弄全粘上来吧,

running on    8 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    8 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  6 types and  270 ions

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|  ADVICE TO THIS USER RUNNING 'VASP/VAMP'   (HEAR YOUR MASTER'S VOICE ...):  |
|                                                                             |
|      You have a (more or less) 'large supercell' and for larger cells       |
|      it might be more efficient to use real space projection operators      |
|      So try LREAL= Auto  in the INCAR   file.                               |
|      Mind: If you want to do a very accurate calculations keep the          |
|      reciprocal projection scheme          (i.e. LREAL=.FALSE.)             |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

  No initial positions read in
9楼2011-05-23 21:17:54
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


gmy1990(金币+3): 现在发现POSCAR的问题了,每行都得顶格写,不能有空格,这个有点....跑了下,又有新的报错,贴在后面,还请指教! 2011-05-23 22:49:52
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-09-09 18:20:51
dos2unix POSCAR
试一试
嘟啦啦嘟啦啦嘟
10楼2011-05-23 21:49:13
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