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jayen3916

金虫 (小有名气)

[交流] 晶体堆积比较的问题

文章投稿，两个不同晶体分子进行解析比较，其中一个分子的堆积图能够很明显的看到π-π堆积，图上标出π-π环距离，但是另一个分子的堆积图很难看出platon计算出来的π-π堆积，这个图上不画出π-π环之间作用可以吗
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1楼 2011-05-20 14:35:12
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jayen3916

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by aeon8868 at 2011-05-29 09:30:28:
看cg-cg的距离。还有阿尔法、贝塔角。阿尔法小于20度，贝塔小于30度，环距离小于4.2。

Cg(I) Res(I)   Cg(J)  [   ARU(J)]       Cg-Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S     Alpha  Beta Gamma    CgI_Perp    CgJ_Perp  Slippage

Cg(1)  [ 1] -> Cg(5)  [  4655.01]      5.0745  0.9222 0.3308-0.2003  12.6915 61.278 51.18 38.84     -3.9523      3.1809
Cg(4)  [ 1] -> Cg(4)  [  3656.01]      5.7999  0.3746-0.9081-0.1871   2.2303         0 38.54 38.54     -4.5362     -4.5362   3.614
Cg(4)  [ 1] -> Cg(5)  [  4555.01]      4.9872  0.9222 0.3308-0.2003       3.463185.264 15.82 81.60     -0.7284      4.7983
Cg(5)  [ 1] -> Cg(1)  [  4454.01]      5.0745  0.7715 0.6245 0.1215       1.419361.278 38.84 51.18      3.1809     -3.9523
Cg(5)  [ 1] -> Cg(5)  [  3655.01]      4.8269 -0.9222 0.3308 0.2003  -6.2144         0 48.47 48.47      3.2005      3.2005   3.613
这里面的几个作用力应该都算是弱的吧，像这么弱的作用力在文章中需要客观的提出来吗？
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7楼2011-05-29 13:07:23
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
jayen3916(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by jayen3916 at 2011-05-20 14:35:12:
文章投稿，两个不同晶体分子进行解析比较，其中一个分子的堆积图能够很明显的看到π-π堆积，图上标出π-π环距离，但是另一个分子的堆积图很难看出platon计算出来的π-π堆积，这个图上不画出π-π环之间作用可以吗

如是因为结构复杂导致看不出来, 那么可以简化一下再画 (删除一些无关紧要的结构部分).

如果pi-pi比较弱,可以不讨论, 不讨论,就不画.

如讨论了, 一个画, 一个不画, 似乎没有道理.
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3楼2011-05-20 14:59:15
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jayen3916

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2011-05-20 14:59:15:
如是因为结构复杂导致看不出来, 那么可以简化一下再画 (删除一些无关紧要的结构部分).

如果pi-pi比较弱,可以不讨论, 不讨论,就不画.

如讨论了, 一个画, 一个不画, 似乎没有道理.

拍拍作用力强弱是看Cg-Cg距离吗？
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4楼2011-05-21 10:19:14
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by jayen3916 at 2011-05-21 10:19:14:
拍拍作用力强弱是看Cg-Cg距离吗？

距离是最主要的判据。 这方面文献很多。 我记得我以前还上载过一些。 不过我没有专门研究过， 所以也不太熟悉。
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5楼2011-05-21 15:38:21
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