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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 一个关于BSSE校正的问题
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liuzhengjun0427

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 一个关于BSSE校正的问题 已有3人参与

要计算A、B两个分子的相互作用能，在Gaussian中使用counterpoise=2关键字（可简写为counter=2），会计算5个体系，输出的能量按照如下顺序：
E_AB：A、B基组下AB复合物的能量
E_A,bAB：A、B基组下A的能量
E_B,bAB：A、B基组下B的能量
E_A：A基组下A的能量
E_B：B基组下B的能量


请问大家最后计算A、B两个分子的相互作用能时，A,B的能量是取的A和B在孤立状态下经过优化后的能量，还是直接从上面的输出的五个能量中取？？？
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1楼 2011-05-14 21:47:36
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vigaryang

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
以我自己的了解，一般都是取孤立状态下经过优化后的能量
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2楼2011-05-15 15:57:11
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liuzhengjun0427

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2011-05-15 15:57:11:
以我自己的了解，一般都是取孤立状态下经过优化后的能量

谢谢！！一直都用的输出文件中给出的五个能量算的相互作用能，看来得重整数据了。
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3楼2011-05-15 16:32:39
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
summary中不是有一个corrected energy么？那个就是考虑了BSSE后得到的
能量，不用翻输出文件自己算的，那样多麻烦。。
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4楼2011-05-15 21:32:02
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 小白如水 at 2011-05-15 21:32:02:
summary中不是有一个corrected energy么？那个就是考虑了BSSE后得到的
能量，不用翻输出文件自己算的，那样多麻烦。。

corrected energy- A-B就好了，A，B都是单独存在时的能量
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5楼2011-05-15 21:33:18
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liuzhengjun0427

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 小白如水 at 2011-05-15 21:33:18:
corrected energy- A-B就好了，A，B都是单独存在时的能量

我也是这样算的，但是后来一想不对，这里的A，B的能量和A，B单独优化的能量是有差别的。因为A，B相互作用后结构上是会有变化的，所以上来请教一下大家！看看大家都是怎么算的
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6楼2011-05-15 22:14:27
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
Originally posted by liuzhengjun0427 at 2011-05-15 22:14:27:
我也是这样算的，但是后来一想不对，这里的A，B的能量和A，B单独优化的能量是有差别的。因为A，B相互作用后结构上是会有变化的，所以上来请教一下大家！看看大家都是怎么算的

A、B共同存在下的能量肯定和A、B单独存在时不一样。共同存在就会存在相互作用，使A、B的构型发生变化，但是这种变化导致的能量变化当然也要算到他们的相互作用力里嘛 所以用A、B单独存在的能量是对的。你要是用共同存在下A、B的能量，那减去后不就成BSSE能量了嘛 倒错了
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7楼2011-05-16 09:34:11
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liuzhengjun0427

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 小白如水 at 2011-05-16 09:34:11:
A、B共同存在下的能量肯定和A、B单独存在时不一样。共同存在就会存在相互作用，使A、B的构型发生变化，但是这种变化导致的能量变化当然也要算到他们的相互作用力里嘛 所以用A、B单独存在的能量是对的。你要是 ...

谢谢你的帮助！！
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8楼2011-05-16 09:54:42
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crystal_wang_82

木虫 (小有名气)
★
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相互作用能的计算应该用前三个进行计算的
E_AB：A、B基组下AB复合物的能量
E_A,bAB：A、B基组下A的能量
E_B,bAB：A、B基组下B的能量
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9楼2011-05-17 14:31:31
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