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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 如何将这个分子接上去
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speio

金虫 (小有名气)

[求助] 如何将这个分子接上去

需要做一个模拟的氢键之类的计算，想要在一个晶胞中加入一个分子，进行计算。不知道怎么加进去。我在改变一个分子的时候所有的都跟着改变了。附图，请大家指教。这个类似于定向生长
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1楼 2011-05-09 15:09:43
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speio

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by speio at 2011-05-09 15:09:43:
需要做一个模拟的氢键之类的计算，想要在一个晶胞中加入一个分子，进行计算。不知道怎么加进去。我在改变一个分子的时候所有的都跟着改变了。附图，请大家指教。这个类似于定向生长
[eimg]56/fa/784669_130492517 ...

如何将半胱氨酸的分子放进这个晶体里面
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2楼2011-05-10 13:30:27
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yaodu

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

speio(金币+1): 2011-05-16 14:20:43
speio(金币+4): 2011-05-19 08:38:04
make p1之后再加试试？
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3楼2011-05-10 16:24:44
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speio

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yaodu at 2011-05-10 16:24:44:
make p1之后再加试试？

接上去之后想要计算anneal dynamic得到minimization的势能，用ms中的哪个模块？直接用discover里面的minimizer出错无法计算
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4楼2011-05-16 14:23:02
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yaodu

银虫 (小有名气)
不好意思，没做过有机的计算，等别人回答吧
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5楼2011-05-16 14:35:13
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