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200699wang新虫 (正式写手)
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SMD中恒速牵拉和恒力牵拉有什么区别和联系？
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| SMD中恒速牵拉和恒力牵拉有什么区别和联系？初学NAMD，很多都不太懂，还望高手，多多指教，先谢谢啦！ |
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【答案】应助回帖
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御剑江湖(金币+5): 欢迎常来本版，欢迎回答问题 2011-05-12 09:08:12
200699wang(金币+8): 2011-05-12 14:34:12
御剑江湖(金币+5): 欢迎常来本版，欢迎回答问题 2011-05-12 09:08:12
200699wang(金币+8): 2011-05-12 14:34:12
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进行恒速牵拉时，我们需要首先设定一个假想的原子作为施力原子，这个实际并不存在的原子就叫做假原子（dummy atom）。假原子通过一根假想的弹簧与系统中真实存在的某个原子（称为SMD原子）相连，牵拉时，假原子以恒定的速度运动，因此称这种牵拉方式为恒速牵拉。实际上被牵拉原子（SMD原子）的速度不是恒定的。SMD原子所受拉力由弹簧的形变和弹性系数决定 ：恒力牵拉。我们仍需要固定一个原子并指定另一个原子被牵拉，但是拉力是恒定的，直接作用于SMD原子上。因此不需要指定假原子以及假想弹簧的弹性系数 |
2楼2011-05-12 09:00:00
200699wang
新虫 (正式写手)
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3楼2011-05-12 14:37:37