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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 使用towhee进行GEMC模拟相平衡的MC运动定义问题..
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hyff

铁虫 (初入文坛)

[求助] 使用towhee进行GEMC模拟相平衡的MC运动定义问题..

towhee新手，想使用GEMC方法来模拟二元相平衡。
目前已经建立了两个盒子来模拟气液两相，BOX1初始为气相分子200个，BOX2初始为液相分子200个。

MC运动函数部分是从example里的Amber_IsoPropanol这个基础上尝试改为二元体系的，根据说明将相关的pm2cbswmt，pmcbmt等都赋了两个值，但试算之后发现只有BOX1中的气相分子可以插入BOX2，BOX2中的液相分子无法插入BOX1，结果也就无法达到化学势平衡。

求教使用过towhee进行过GEMC模拟和相平衡模拟的高手指点交流..
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1楼 2011-05-05 09:57:37
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hyff

铁虫 (初入文坛)
★ ★
zh1987hs(金币+2): 鼓励交流 2011-05-06 22:39:14
引用回帖:
Originally posted by 043114076 at 2011-05-06 13:58:56:
不太清楚你使用的是什么分子,我的理解是这样的:由于分子之间结合能比较大使得从液相拿出一个分子相当不容易,所以你可以尝试加大从box2到box1的概率.另外,你的两个初始盒子是怎么得到的?是否合理?

初始盒子是用‘dimensions’的方法建立的，hmatrix矩阵的值是通过密度和分子数算出来的……
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7楼2011-05-06 14:50:26
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-05-05 12:05:11
引用回帖:
Originally posted by hyff at 2011-05-05 09:57:37:
towhee新手，想使用GEMC方法来模拟二元相平衡。
目前已经建立了两个盒子来模拟气液两相，BOX1初始为气相分子200个，BOX2初始为液相分子200个。

MC运动函数部分是从example里的Amber_IsoPropanol这个基础上尝试 ...

GEMC貌似有一个更好的代码。。。
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好好学习，天天向上。
2楼2011-05-05 10:38:06
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hyff

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-05-05 10:38:06:
GEMC貌似有一个更好的代码。。。

哦？是么，我看一般GEMC做相平衡模拟都用的是towhee啊……
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3楼2011-05-05 10:42:40
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043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
hyff(金币+2): 感谢回应~ 2011-05-05 14:29:04
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-05-05 21:29:24
我也尝试过气液平衡模拟，确实比较难
你的pm2cbswmt，pmcbmt　如何赋值的贴出来看看，
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4楼2011-05-05 13:22:11
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