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使用towhee进行GEMC模拟相平衡的MC运动定义问题..
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towhee新手，想使用GEMC方法来模拟二元相平衡。 目前已经建立了两个盒子来模拟气液两相，BOX1初始为气相分子200个，BOX2初始为液相分子200个。 MC运动函数部分是从example里的Amber_IsoPropanol这个基础上尝试改为二元体系的，根据说明将相关的pm2cbswmt，pmcbmt等都赋了两个值，但试算之后发现只有BOX1中的气相分子可以插入BOX2，BOX2中的液相分子无法插入BOX1，结果也就无法达到化学势平衡。 求教使用过towhee进行过GEMC模拟和相平衡模拟的高手指点交流.. |
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3楼2011-05-05 10:42:40
2楼2011-05-05 10:38:06
043114076
木虫 (正式写手)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 3364.9
- 散金: 52
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- 帖子: 788
- 在线: 369.5小时
- 虫号: 570592
- 注册: 2008-06-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2011-05-05 13:22:11
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御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-05-05 21:29:38
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-05-05 21:29:38
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贴一个我最新修改的，因为这个东西我们组之前完全没人做过，我是第一个做的……然后都是按我自己的理解写的，哪里不对的烦请指正一下。 pmvol 0.002d0 pmvlpr 1.0d0 rmvol 0.1d0 tavol 0.5d0 pm2boxcbswap 0.4d0 pm2cbswmt 0.5d0 1.0d0 pm2cbswpr 1.0d0 pmcb 0.6d0 pmcbmt 0.5d0 1.0d0 pmall 0.0d0 0.0d0 pmtracm 0.8d0 pmtcmt 0.5d0 1.0d0 rmtrac 0.5d0 tatrac 0.5d0 pmrotate 1.0d0 pmromt 0.5d0 1.0d0 rmrot 0.05d0 tarot 0.5d0 |
5楼2011-05-05 14:30:26