24小时热门版块排行榜    

查看: 2517  |  回复: 4

xueke227

新虫 (初入文坛)

[求助] SIESTA几何优化不收敛是不是就说明了这个结构是不稳定的?

RT:算得是一个BN sheet  掺一个Ti原子 后 再吸附一个氢气分子的模型
     算了两次  没有考虑自旋没有收敛 老师让加入自旋再算一次 还是没有收敛
     总分子数:55 个  Ti原子位于BN  sheet的 H 位
     上脚本:


SystemName             BNSheetGGA     # Descriptive name of the system

SystemLabel            1H2TiH  # Short name for naming files



NumberOfAtoms       53

NumberOfSpecies     4



%block ChemicalSpeciesLabel

  1  5   B

  2  7   N

  3  22  Ti

  4  1   H   

%endblock ChemicalSpeciesLabel



XC.functional  GGA

XC.authors     PBE



#----------------------------------------------------------------

LatticeConstant    1 Ang   # Lattice constant alat

%block LatticeVectors               

12.55    0.0    0.0

0.0      12.55  0.00

0.0      0.0    15.00    # c=15 A for the vacuum space

%endblock LatticeVectors

#---------------------------------------------------------------

#---------------------------------------------------------------

%block kgrid_Monkhorst_Pack

1 0 0   0.0

0 1 0   0.0

0 0 1   0.0

%endblock kgrid_Monkhorst_Pack

#-----------------------------------------------------------------------

#-----------------------------------------------------------------------

# SCF options

MaxSCFIterations      100      # Maximum number of SCF iter

DM.NumberPulay         5            # One Pulay every 5 iter

DM.MixingWeight       0.25          # New DM amount for next SCF cycle

DM.Tolerance          1.d-4         # Tolerance in maximum difference

#DM.UseSaveDM          true            # to use continuae..ion files

#SolutionMethod        diagon        # OrderN or Diagon



MeshCutoff           150. Ry         # This data is powered by MS

OccupationFunction   FD

ElectronicTemperature  250 meV       # Temp. for Fermi smearing

# MD

MD.TypeOfRun         broyden

MD.NumCGsteps        16          #Please Pay Enough ATTENTION on this!!!

MD.MaxForceTol       0.05 eV/Ang

#Spined

SpinPolarized T

#------------------------------------------------------------------------

#OUTPUT OPTION

LongOutput   T

AtomicCoordinatesFormat    Ang  

%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies <1H2TiH.xyz
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ifmc1234

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-05-02 19:59:46
xueke227(金币+1): 2011-05-03 14:39:43
首先不知道你这个体系是否有周期性,假如有,在这块
%block kgrid_Monkhorst_Pack
1 0 0   0.0
0 1 0   0.0
0 0 1   0.0
%endblock kgrid_Monkhorst_Pack
增加K点。
第二,对于吸附一个氢气分子的模型
个人觉得除非你用vwd泛函(siesta有development版本),否则考虑的方法会有问题,方法没选对,结果就没多大的意义。
2楼2011-05-02 17:11:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangsong1016

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-05-03 14:43:25
有没有尝试过MD.TypeOfRun CG? 我很早之前用broyden做过简单的尝试,好像不是那么容易收敛,CG相比较容易收敛一些。但是两种算法的差别我还是不明白,希望能有高人指教。到底其中的物理思想是什么?
3楼2011-05-03 14:06:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueke227

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by ifmc1234 at 2011-05-02 17:11:47:
首先不知道你这个体系是否有周期性,假如有,在这块
%block kgrid_Monkhorst_Pack
1 0 0   0.0
0 1 0   0.0
0 0 1   0.0
%endblock kgrid_Monkhorst_Pack
增加K点。
第二,对于吸附一个氢气分子的模型
个 ...

1.周期性是有的 1X1X1的k点只是为了先粗略的判定一下收敛情况 这样想对不对?
2.如果说不收敛是不是就可以认为这组模型是不稳定的?
3.VWD泛函  这个我真的不知道
  计算方法我们用的就是GGA+PBE 有问题?
4楼2011-05-03 14:47:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ifmc1234

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

xueke227(金币+2): 2011-05-04 15:33:11
引用回帖:
Originally posted by xueke227 at 2011-05-03 14:47:02:
1.周期性是有的 1X1X1的k点只是为了先粗略的判定一下收敛情况 这样想对不对?
2.如果说不收敛是不是就可以认为这组模型是不稳定的?
3.VWD泛函  这个我真的不知道
  计算方法我们用的就是GGA+PBE 有问题?

理论上没问题,但是有时k点太少,也影响收敛。
还有3楼说的改为CG,用Pulay方法而不是broyden,虽然很多时候broyden收敛要快些。
假如想先判断收敛情况,也可以用harris_functional这个方法算一下。
考虑到分子之间的范德瓦尔斯作用,gga是不够的。
5楼2011-05-03 17:33:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xueke227 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] 明天应该可查了!? +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +7 图啦图啦 2026-08-24 8/400 2026-08-24 22:00 by maomao_da
[基金申请] 人气不行了 +10 fansofjerry 2026-08-21 10/500 2026-08-24 21:03 by zhanghaozhu
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见