24小时热门版块排行榜    

查看: 1412  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

量化新手

新虫 (正式写手)

[求助] [求助]AMBER数据分析问题

[xmpu208@localhost md_vac]$ touch linuxsir007.txt
[xmpu208@localhost md_vac]$ ls -lh linuxsir007.txt
-rw-rw-r-- 1 xmpu208 xmpu208 0 Apr 29 15:49 linuxsir007.txt
[xmpu208@localhost md_vac]$ chmod 755 linuxsir007.txt
[xmpu208@localhost md_vac]$ ls -lh linuxsir007.txt
-rwxr-xr-x 1 xmpu208 xmpu208 0 Apr 29 15:49 linuxsir007.txt
[xmpu208@localhost md_vac]$ ./process_mdout.perl ../md_vac.out
-bash: ./process_mdout.perl: Permission denied
提示我已经修改好了权限,怎么还是提示我没有权限呢,求大侠帮忙啊,不胜感激
回复此楼
新手上路,请多关照
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

量化新手

新虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by petersen at 2011-05-03 10:03:08:
perl ./process_mdout.perl ../md_vac.out试一下这个。然后你文件的路径应该保证没错。

[xmpu208@localhost md_vac]$ perl ./process_mdout.perl ../md_vac.out
Processing sander output file (../md_vac.out)...
Starting output...
Outputing summary.TEMP
Outputing summary_avg.TEMP
Outputing summary_rms.TEMP
Outputing summary.TSOLUTE
Outputing summary_avg.TSOLUTE
Outputing summary_rms.TSOLUTE
Outputing summary.TSOLVENT
Outputing summary_avg.TSOLVENT
Outputing summary_rms.TSOLVENT
Outputing summary.PRES
Outputing summary_avg.PRES
Outputing summary_rms.PRES
Outputing summary.EKCMT
Outputing summary_avg.EKCMT
Outputing summary_rms.EKCMT
Outputing summary.ETOT
Outputing summary_avg.ETOT
Outputing summary_rms.ETOT
Outputing summary.EKTOT
Outputing summary_avg.EKTOT
Outputing summary_rms.EKTOT
Outputing summary.EPTOT
Outputing summary_avg.EPTOT
Outputing summary_rms.EPTOT
Outputing summary.DENSITY
Outputing summary_avg.DENSITY
Outputing summary_rms.DENSITY
Outputing summary.VOLUME
Outputing summary_avg.VOLUME
Outputing summary_rms.VOLUME
Outputing summary.ESCF
Outputing summary_avg.ESCF
Outputing summary_rms.ESCF

我试过之后出现这样的,应该对了吧,呵呵,谢谢啊,但是不是很懂为什么前面要加一个perl ,教程上不是这样的,而是process_mdout.perl ../md_vac.out
网上有人说用./process_mdout.perl ../md_vac.ou也行,所以我用的那个,结果没弄出来,可以帮我解释一下命令的含义吗?
新手上路,请多关照
8楼2011-05-03 10:11:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

petersen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-05-03 17:26:42
process_mdout.perl 的权限没有修改吧?需要把它修改为可运行文件的啊!你那个修改tex文件的权限干什么?
2楼2011-05-01 09:26:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

量化新手

新虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by petersen at 2011-05-01 09:26:31:
process_mdout.perl 的权限没有修改吧?需要把它修改为可运行文件的啊!你那个修改tex文件的权限干什么?

我是在网上查的啊,我并不知道怎么修改,希望你教教我啊,谢谢咯,怎么把它修改成可执行文件,请赐教啊
新手上路,请多关照
3楼2011-05-03 08:51:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

petersen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
量化新手(金币+2): 谢谢啦 2011-05-03 09:50:57
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-05-03 17:26:52
你不是会么!chmod 777 process_mdout.perl 这个将文件权限修改为可读写运行的文件。
4楼2011-05-03 09:14:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] 326求调剂 +4 mlpqaz03 2026-03-15 4/200 2026-03-21 19:10 by ColorlessPI
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-20 7/350 2026-03-21 19:05 by 15709483992
[考研] 一志愿南大,0703化学,分数336,求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 【考研调剂】化学专业 281分,一志愿四川大学,诚心求调剂 +11 吃吃吃才有意义 2026-03-19 11/550 2026-03-21 18:23 by 学员8dgXkO
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +6 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-21 17:21 by 学员8dgXkO
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 303求调剂 +5 睿08 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:11 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 考研调剂求学校推荐 +3 伯乐29 2026-03-18 5/250 2026-03-20 22:59 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂 +16 于海海海海 2026-03-19 16/800 2026-03-20 22:28 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:35 by 学员8dgXkO
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 生物学调剂招人!!! +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +10 慕寒mio 2026-03-16 10/500 2026-03-19 15:26 by 丁丁*
[考研] 本科郑州大学物理学院,一志愿华科070200学硕,346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
信息提示
请填处理意见