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plafalines

捐助贵宾 (小有名气)

[求助] 小弟刚学tinker 很多问题搞不清楚啊

建立了一个800多个水的盒子

总是出现:

Molecular Dynamics Trajectory via Velocity Verlet Algorithm

RATTLE  --  Warning, Distance Constraints not Satisfied

TINKER is Unable to Continue; Terminating the Current Calculation

真心困惑~~求教

还有 哪里可以下载tinker的windows版本的啊  

我在网上貌似找到 无法下载

[ Last edited by plafalines on 2011-4-26 at 19:32 ]
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qphll

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-05-02 14:14:47
如果自己想写一些代码, 或者在做其他计算, 比如fit 力场的时候, 套用一下MD, 那么Tinker不错, 比较容易上手. 如果纯粹的将Tinker作为一个MD的计算引擎, 它的速度及其不快. 建议转gromacs 或者 lammps
Life, Love, Laugh.
8楼2011-05-02 11:41:54
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