| 查看: 2578 | 回复: 22 | |||
| 本帖产生 1 个 模拟EPI ，点击这里进行查看 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
shiyiwenren至尊木虫 (著名写手)
|
[求助]
多孔芳香框架（PAF）的模型构建
|
||
|
最近看到一篇文献是做多孔芳香框架（PAF）的CO2吸附模拟的，在文献中提到了PAF-1模型构建的方法，感觉这种方法可能用处还是很大的，但是自己尝试的时候在第一步就卡住了，所以向大家求助一下。下面简单叙述一下PAF-1构建过程，并将自己的问题一并提出。 1. 导入金刚石的晶胞，将晶胞中的C-C键取代为联苯，取代后的结构用MS中的forcite进行结构优化。（问题：怎么样才能将金刚石中的C取代成苯环，MS的modification只能将一种元素换成另一种元素，有没有什么操作是可以实现将元素取代成基团的？） 2. 通过逐步操作将有四面体碳相连的联苯环形成一个大的簇 3.利用MS中的AC模块构建出一个三维的无定形的PAF-1晶胞 [ Last edited by shiyiwenren on 2011-4-26 at 15:27 ] |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
changlianze» 猜你喜欢
工科08-机械专硕-求调剂
已经有3人回复
-
一志愿苏州大学材料工程（085601）专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项
已经有9人回复
-
材料工程302分求调剂
已经有8人回复
-
315求调剂
已经有14人回复
-
307分材料专业求调剂
已经有7人回复
-
材料调剂
已经有11人回复
-
262求调剂
已经有6人回复
-
一志愿北京交通大学材料工程总分358求调剂
已经有4人回复
-
一志愿青科085500，初试295分，公共课213分
已经有3人回复
-
304求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Diamond画氢键，构建晶体，立体模型结构，使用技巧等
已经有522人回复
- 用Material Studio和Gausian View构建二茂铁（Ferrocene）分子模型的详细步骤
已经有214人回复
- 如何利用castep建立Ba0.75Sr0.25TiO3的晶胞模型啊？？
已经有7人回复
- 分数布朗运动的金融模型意义如何？
已经有9人回复
- 大型强子对撞机实验结果可能颠覆标准模型
已经有3人回复
- 实验数据的数学模型构建、曲线拟合方面问题求助
已经有6人回复
- 中国科学院生态环境研究中心流域水环境模型与管理研究组招聘博士后2人
已经有5人回复
- 【求助】关于ANSYS在体模型的表面施加面载荷的问题
已经有13人回复
- 【求助】DMOL 构建簇模型如何添加点电荷来消除边界效应
已经有15人回复
- 【讨论】荷瘤大鼠模型构建方法
已经有7人回复
shiyiwenren
至尊木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 11811.9
- 散金: 29
- 红花: 17
- 帖子: 2450
- 在线: 1187.2小时
- 虫号: 886290
- 注册: 2009-10-28
- 专业: 分离过程
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+5, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-05-04 21:23:05
御剑江湖(金币+5, 模拟EPI+1): 谢谢 2011-05-04 21:23:05
|
我发邮件问了这篇论文的作者了，他给出的做法如下： 1. First convert the diamond structure into primitive cell using the Build module in Material Studio. 2. Change the lattice parameter to a/1.4 (here a is the lattice constant of PAF-1 structure i.e. a= 23.7195). 3. Replace the C-C with biphenyl in the primitive cell. 4. Finally redefine the lattice parameter under Build module as A = 1 1 -1 B= -1 1 -1 and C = -1 1 1 5. Then optimize the structure using the forcite module in MS. 但是我尝试了下，在第三步的将C-C代替为联苯基团还是无法完成，你可以试试看，如果成功的话还望能够和大家分享一下 |
10楼2011-05-04 15:37:56
2楼2011-04-26 22:08:13
shiyiwenren
至尊木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 11811.9
- 散金: 29
- 红花: 17
- 帖子: 2450
- 在线: 1187.2小时
- 虫号: 886290
- 注册: 2009-10-28
- 专业: 分离过程
3楼2011-04-26 22:40:24
4楼2011-04-26 22:53:42
