24小时热门版块排行榜    

查看: 325  |  回复: 2

Jfreda

铁虫 (小有名气)

[求助] 参数设置

请问一下用gromacs对体系升温的过程中,gen_vel和gen_temp两个参数该怎么设?下面是我升温的过程;

protein_ligand     popc    sol_ ion
          0                 0           50               50ps      pr1.mdp
          0                 0          150              50ps      pr2.mdp
          0                 0          310              50ps      pr3.mdp
          0               50          310              50ps      pr4.mdp
          0              150         310              50ps      pr5.mdp
          0              310         310              50ps      pr6.mdp
        50              310         310              20ps      pr7.mdp
       150            310          310              20ps      pr8.mdp
        310            310         310              20ps      pr9.mdp
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Jfreda

铁虫 (小有名气)

等待回复,
2楼2011-04-24 22:34:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)

天池冶海

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by Jfreda at 2011-04-24 21:14:21:
请问一下用gromacs对体系升温的过程中,gen_vel和gen_temp两个参数该怎么设?下面是我升温的过程;

protein_ligand     popc    sol_ ion
          0                 0           50               50ps     ...

近期我版在做活动,去本主题提问,会有很多牛牛会详细回答你,谢谢。
[交流] 【500金币分子模拟版块活动】“经验力场分子模拟+第一性原理计算问题讨论互助及资源共享”
详见:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3119249&fpage=1
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 御剑江湖 的 500 个金币,回帖就立即获得 1 个金币,每人有1次机会
莫问前尘事,只怜今世缘,承临纵横风,御剑凡尘路,蹉跎浮华,嬉笑洒脱。
3楼2011-04-25 09:27:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Jfreda 的主题更新
信息提示
请填处理意见