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参数设置
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请问一下用gromacs对体系升温的过程中，gen_vel和gen_temp两个参数该怎么设？下面是我升温的过程; protein_ligand popc sol_ ion 0 0 50 50ps pr1.mdp 0 0 150 50ps pr2.mdp 0 0 310 50ps pr3.mdp 0 50 310 50ps pr4.mdp 0 150 310 50ps pr5.mdp 0 310 310 50ps pr6.mdp 50 310 310 20ps pr7.mdp 150 310 310 20ps pr8.mdp 310 310 310 20ps pr9.mdp |
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2楼2011-04-24 22:34:48
御剑江湖
荣誉版主 (著名写手)
天池冶海
- 模拟EPI: 15
- 应助: 7 (幼儿园)
- 贵宾: 6.831
- 金币: 9082.9
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- 虫号: 1229656
- 注册: 2011-03-11
- 专业: 电机与电器
- 管辖: 第一性原理
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近期我版在做活动，去本主题提问，会有很多牛牛会详细回答你，谢谢。 [交流] 【500金币分子模拟版块活动】“经验力场分子模拟+第一性原理计算问题讨论互助及资源共享” 详见：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3119249&fpage=1 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 御剑江湖 的 500 个金币，回帖就立即获得 1 个金币，每人有1次机会 |
3楼2011-04-25 09:27:29