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Jfreda

铁虫 (小有名气)

[求助] 参数设置

请问一下用gromacs对体系升温的过程中,gen_vel和gen_temp两个参数该怎么设?下面是我升温的过程;

protein_ligand     popc    sol_ ion
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          0                 0          150              50ps      pr2.mdp
          0                 0          310              50ps      pr3.mdp
          0               50          310              50ps      pr4.mdp
          0              150         310              50ps      pr5.mdp
          0              310         310              50ps      pr6.mdp
        50              310         310              20ps      pr7.mdp
       150            310          310              20ps      pr8.mdp
        310            310         310              20ps      pr9.mdp
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御剑江湖

荣誉版主 (著名写手)

天池冶海

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by Jfreda at 2011-04-24 21:14:21:
请问一下用gromacs对体系升温的过程中,gen_vel和gen_temp两个参数该怎么设?下面是我升温的过程;

protein_ligand     popc    sol_ ion
          0                 0           50               50ps     ...

近期我版在做活动,去本主题提问,会有很多牛牛会详细回答你,谢谢。
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莫问前尘事,只怜今世缘,承临纵横风,御剑凡尘路,蹉跎浮华,嬉笑洒脱。
3楼2011-04-25 09:27:29
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