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dingfengbo

新虫 (小有名气)

[求助] encut测试是否需要修改要提交的作业脚本

我想做encut测试这是我的encut脚本:
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for a in 400 450 500 550 600 650 700 750
do
cat >INCAR < SYSTEM=CGa
LPLANE=.TRUE.
NPAR=8
LREAL = .TRUE.
PREC    = Accurate
EDIFF   =1E-6
EDIFFG  = -0.03      
IALGO   = 48         
NELMIN  = 4         
ISYM    = 0         
ISPIN = 1
NBANDS = 240
LCHARG  = .TRUE.
LWAVE   = .TRUE.     
LVTOT   = .FALSE.
NBLOCK  = 1         
NSW     = 10
IBRION  = 2
POTIM=0.3
ISMEAR = 0   
SIGMA = 0.05
ENCUT=$a
ISTART=0;ICHARG=2
!
echo "ENCUT=$a eV"
vasp
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5 }'`
echo $a $E >>comment
done
测试的时候我想将之提交,下面是我的作业脚本:
#!/bin/sh
#PBS -l nodes=2:ppn=8
#PBS -u XX
#PBS -N YY

JOBINFOR=$PBS_JOBID
MASTERNODE=`hostname`
SCRATCHDIR=$PBS_JOBID
NCPU=`wc -l < $PBS_NODEFILE`

SERVER=$PBS_O_HOST
WORKDIR=$PBS_O_WORKDIR
MKDIR=/bin/mkdir
RSH=/usr/bin/rsh
CP=/bin/cp
cat $PBS_NODEFILE > $WORKDIR/mpihosts
LAUNCH="mpirun --hostfile  $WORKDIR/mpihosts -np $NCPU"
PROGRAMEXEC="/opt/vasp/vasp"

${RSH} ${MASTERNODE}
cd ${WORKDIR}
${MKDIR} ${SCRATCHDIR}
cd ${SCRATCHDIR}
${CP} ${WORKDIR}/* .
${LAUNCH}  ${PROGRAMEXEC} > out 2>&1
请问我怎样修改作业脚本才能进行encut测试的计算呢?谢谢
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bingmou

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


youzhizhe(金币+1, 1ST强帖+1): 谢谢指导。 2011-04-23 08:13:11
如果知识测试小体系的话,建议不要提交,直接单机运行。如果是大体系的话,估计一个ecut就可以了,如果全部是金属,400eV足够;如果有O,N可能要700eV。其他的都可以采用赝势中默认值。
如果一定要提交,可以考虑把这句
PROGRAMEXEC="/opt/vasp/vasp"
改为
PROGRAMEXEC='脚本位置”
2楼2011-04-22 22:58:54
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