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dingfengbo

新虫 (小有名气)

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[求助] encut测试是否需要修改要提交的作业脚本

我想做encut测试这是我的encut脚本：
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for a in 400 450 500 550 600 650 700 750
do
cat >INCAR < SYSTEM=CGa
LPLANE=.TRUE.
NPAR=8
LREAL = .TRUE.
PREC = Accurate
EDIFF =1E-6
EDIFFG  = -0.03
IALGO = 48
NELMIN  = 4
ISYM = 0
ISPIN = 1
NBANDS = 240
LCHARG  = .TRUE.
LWAVE = .TRUE.
LVTOT = .FALSE.
NBLOCK  = 1
NSW    = 10
IBRION  = 2
POTIM=0.3
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.05
ENCUT=$a
ISTART=0;ICHARG=2
!
echo "ENCUT=$a eV"
vasp
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5 }'`
echo $a $E >>comment
done
测试的时候我想将之提交，下面是我的作业脚本：
#!/bin/sh
#PBS -l nodes=2:ppn=8
#PBS -u XX
#PBS -N YY

JOBINFOR=$PBS_JOBID
MASTERNODE=`hostname`
SCRATCHDIR=$PBS_JOBID
NCPU=`wc -l < $PBS_NODEFILE`

SERVER=$PBS_O_HOST
WORKDIR=$PBS_O_WORKDIR
MKDIR=/bin/mkdir
RSH=/usr/bin/rsh
CP=/bin/cp
cat $PBS_NODEFILE > $WORKDIR/mpihosts
LAUNCH="mpirun --hostfile  $WORKDIR/mpihosts -np $NCPU"
PROGRAMEXEC="/opt/vasp/vasp"

${RSH} ${MASTERNODE}
cd ${WORKDIR}
${MKDIR} ${SCRATCHDIR}
cd ${SCRATCHDIR}
${CP} ${WORKDIR}/* .
${LAUNCH}  ${PROGRAMEXEC} > out 2>&1
请问我怎样修改作业脚本才能进行encut测试的计算呢？谢谢

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1楼 2011-04-22 16:37:10

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haowenping

木虫 (著名写手)

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引用回帖:

Originally posted by dingfengbo at 2011-04-22 16:37:10:
我想做encut测试这是我的encut脚本：
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for a in 400 450 500 550 600 650 700 750
do
cat >INCAR <<!
SYSTEM=CGa
LPLANE=.TRUE.
NPAR=8
LREAL = .TRUE.
PREC = Accura ...

你好，请问你有没有实现在pbs下优化你的那个截断能脚本？我现在也被这个问题困惑，如果你会了的话麻烦指教下我，谢谢了！

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人有多大胆，地有多大产！

3楼2011-05-07 19:07:03

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