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哪位大虾有分析基因表达差异的软件啊？
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| 各位大侠，我通过RT-PCR做的基因表达，然后跑的凝胶电泳，现在想求一个软件能分析跑出来的条带的表达差异，哪位大虾知道啊？希望能不吝赐教啊，非常感谢啊 |
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5楼2011-04-21 21:11:09
西瓜
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4楼2011-04-21 17:02:22
西瓜
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+6, EPI+1): good 2011-04-21 21:44:51
dhd997(金币+6, EPI+1): good 2011-04-21 21:44:51
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你可以下载这个免费的 ImageJ： http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html 在里面选择与你的操作系统对应的软件，一般是32位的Windows吧：  http://rsbweb.nih.gov/ij/download/win32/ij144-jdk6-setup.exe1.下载安装之后，打开软件，点击 File>Open，打开你要分析的图片； 2.点击工具栏最左边的矩形工具（Rectangular），然后框出要分析的条带； 按Ctrl+M（或者点击菜单栏Analyze>Measure），打开测量的Results窗口，里面的Area，Mean，Min，Max依次是面积，灰度平均值，灰度最小值，灰度最大值。其中的Mean就是你需要的。 3.可以放大或缩小图片：点击工具栏的放大镜图标，鼠标左键点击图片放大，右击缩小。 4.测完一个条带，再框出另一条条带，按Ctrl+M，又得到新的值。重复操作直到所有条带都分析完。结果都显示在Results窗口。 5.Results窗口的数据可以Clear，或者Copy出来，这些就不细说了吧！  说明：条带越白，数值越大，纯黑是0，纯白是255，这个适用于DNA琼脂糖凝胶电泳（黑色背景，白色条带）；如果是蛋白质的SDS-PAGE（背景是白色，条带是黑色），这时只需要用255减去测得的Mean值就ok了。这个软件是免费、开源的，有很多插件可以下载，功能很强大滴。有兴趣多多研究吧。 http://rsbweb.nih.gov/ij/plugins/index.html [ Last edited by 西瓜 on 2011-4-21 at 21:30 ] |
6楼2011-04-21 21:27:25
7楼2011-04-21 22:29:59
