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apheyh

银虫 (小有名气)

[求助] 请教各位做植物转基因的虫子-关于PCR引物设计

请教各位植物转基因的高手高手高高手:小弟我找同学要了转pCAMBIA1301 质粒(空质粒) 的拟南芥转基因系。需要PCR扩增35S 启动子,GUS 两个外显子,一个内含子,还有NOS polyA 终止子部分;即从35S启动子到NOS polyA 终止子 片段部分;全长一共2852bp, 打算一共分两段扩增,第一段始于LacZ 的alpha 片段部分,终于GUS第二个外显子的编码区域,共1618bp;第二段始于GUS第二个外显子的编码区域,终于NOS PolyA 和右边界之间的区域 (应该也算内含子吧),全长1649bp,  使用这两对引物直接扩增pCAMBIA 1301 质粒,效果非常好 (PCR 扩增片段长度和测序结果都很好),但使用这两对引物扩增pCAMBIA1301 质粒(空质粒) 的拟南芥转基因系,能扩增出片段,但长度不对,第一对引物扩增出的片段长度为 2000bp左右,而第二对扩增出的片段长度为1000bp左右,测序结果显示,根本不是我想要的序列,请问这是什么原因?是不是我设计引物有哪个地方不对的?我应该怎么做??多谢多谢!!
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