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111602

木虫 (著名写手)

[交流] 线性化及完整的质粒电泳问题。 已有8人参与

最近在做实验过程中,遇到要将质粒先线性化,发现用酶切后电泳,与未酶切的质粒相比,跑的速度要快,不知是何原因,这些质粒都非空载,有些不理解,一般线性后跑的速度应该比超螺旋快才对啊。请高手指教!

首先感谢各位的讨论和建议。但必须说明一点,这个质粒是重组的,而且选择的酶只有一个酶切位点,电泳用的是1% AGAROSE GEL. 120V  30MIN.并且可以肯定已经被线性化的了。因为后继实验如果没有被线性化是无法成功的。


大家的回答都是建立在理论分析基础上的。我也赞同这一理论,但不知道有没有真正做过这一实验的朋友,可能我的实验(电泳)出了问题,但希望有实践经验的朋友给点意见。

[ Last edited by 111602 on 2011-4-21 at 01:42 ]
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xuguanghai

木虫 (职业作家)


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Originally posted by 天使托 at 2011-04-20 10:05:43:
什么叫未必如此?
质粒一般有三种状态,线性质粒;开环的;超螺旋的;一般前以最快的是超螺旋,其次是开环的,然后才是线性的。

超螺旋>线形>开环,不是这个吗?
5楼2011-04-20 10:31:29
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xuguanghai

木虫 (职业作家)

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1949stone(金币+2): 貌似 2011-04-20 10:46:07
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Originally posted by 111602 at 2011-04-20 08:28:01:
最近在做实验过程中,遇到要将质粒先线性化,发现用酶切后电泳,与未酶切的质粒相比,跑的速度要快,不知是何原因,这些质粒都非空载,有些不理解,一般线性后跑的速度应该比超螺旋快才对啊。请高手指教!

酶切后跑得快,应该是质粒变成片段了,看你质粒以及酶的关系了,还有
超螺旋>线形>开环,
6楼2011-04-20 10:34:50
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xuguanghai

木虫 (职业作家)

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dhd997(金币+2): 有理有据,欢迎交流 2011-04-20 10:51:34
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Originally posted by 天使托 at 2011-04-20 10:37:47:
http://zhidao.baidu.com/question/211352024.html
你觉得呢?超螺旋是跑的最快滴!

http://zhidao.baidu.com/question/217768279.html?an=0&si=1
8楼2011-04-20 10:49:36
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xuguanghai

木虫 (职业作家)


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Originally posted by 天使托 at 2011-04-20 11:03:31:
此链接说的不无道理,首先明确的是超螺旋是跑的最快的,可是线性和环状相比谁快一点,个人还是认为开环的跑得快。。。

详情请参见
基因操作原理第六版(Principles of Gene Manipulation)
瞿礼嘉 顾红雅 ...

恩,谢谢,去看看
10楼2011-04-20 11:06:52
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