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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【讨论】有什么好的软件可以比较合理的构建分子的立体结构？
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pkuchemistry

捐助贵宾 (著名写手)

[交流] 【讨论】有什么好的软件可以比较合理的构建分子的立体结构？

rt，画分子结构之后欲变成3D结构，但是用chemdraw 3D转变的话往往结果并不好，尤其是比较复杂一些的分子都缩成一团了，根本就不是合理的空间结构。大家有没有好的软件、方法去构建尽可能合理的分子的立体结构呢？尤其是，在与蛋白对接之前的分子3D结构的优化。大家能告诉一下吗？多谢！！！！
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1楼2011-04-17 16:38:04
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xioooli

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-04-20 17:16:33
avogadro 或者 openbabel，可以简单的立场优化。
赞一下(2人) 回复此楼
10楼2011-04-20 09:07:59
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pkuchemistry

捐助贵宾 (著名写手)
再顶出去！
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3楼2011-04-18 20:21:53
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pkuchemistry

捐助贵宾 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by pbfxql at 2011-04-19 12:03:25:
chemoffice

无语，不给金币。。
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6楼2011-04-19 15:52:46
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-19 19:17:36
pkuchemistry(金币+3): 2011-04-19 23:17:33
Materials Studio你可以试试，它的Visualizer模块在建立分子模型方面还是很强大的。
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2011-04-19 16:59:41
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