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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】如果理论计算和实验结论相反，您会怎么办？！抓狂ing
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

[交流] 【求助】如果理论计算和实验结论相反，您会怎么办？！抓狂ing

各位高手好 我有个问题很痛苦
组里有个老师做了一个分子的CD谱
（注：该分子的手型不是由于手性碳引起的，而是由于它本身结构的扭曲而造成的CD信号）
为了给她提供实验支持 我就给她模拟CD啊
然后涅 这个分子有三个可能的构型(势能面上的三个局域最小点)
第一个构型能量=0 不出CD峰
第二个构型能量=3KJ/mol CD信号与实验相反
第三个构型能量=15KJ/mol CD信号与实验相同

可能的改进措施：
A 显式溶剂模型？（计算量太大）
B 隐式溶剂模型？（基本不抱期望，估计对各种构型的相对能量影响并不大，因为这位老师用的是非极性或弱极性溶剂）
C 找其他局域最小点？（我已经想破脑袋了，也想不出其他可能的局域最小点，难道这么大的分子让我scan？！？！）
D 实在无法可想了，我干脆本着“实践是检验真理的唯一标准”的原则，谁符合实验我就取谁，其他构型能量再低也不取信，拉倒，我不干了！

抓狂ing
请高手支招！！！谢谢高手们

[ Last edited by yjcmwgk on 2011-4-12 at 11:47 ]
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1楼 2011-04-12 11:44:45
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showcat

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1259382楼: Originally posted by zhou2009 at 2012-04-18 17:55:48:
把溶质溶剂（足够量）分子组合在一起，就是对液相状态的模拟。

初步估计一下，在三维中添加足够量的溶剂溶质，而且要照顾到每个分子间的相对位置关系...这种显式溶剂模型的构建，工作量要相当大了呀！每个分子都要手动设置其在空间的相对位置吗？
赞一下 回复此楼
36楼2012-04-18 19:06:20
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fegg7502

荣誉版主 (知名作家)
★ ★ ★
小红豆(金币+3): 感谢分享你的看法 常来 2011-04-12 13:09:20
yjcmwgk(金币+3): 2011-04-12 14:11:17
具体情况具体分析了，，有可能溶剂有作用，或者你的计算精度不够
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2楼2011-04-12 11:51:26
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小红豆(金币+3): 感谢分享你的看法 2011-04-12 13:09:42
yjcmwgk(金币+3): 2011-04-12 14:11:22
给出多个方法和基组的结果，有可能能量次序不一样，导致结果也不一样。另外，能量最低的构型也有可能没找到

[ Last edited by 冬天里的骄阳 on 2011-4-12 at 11:58 ]
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3楼2011-04-12 11:56:45
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)
★ ★
小红豆(金币+2): 感谢分享你的看法 2011-04-12 13:10:06
yjcmwgk(金币+3): 2011-04-12 14:11:27
虽然我不是很懂量化，但是可以考虑一些选择精度更好的方法，其次还需要验证试验是否准确，别试验做的是错的，你在这里瞎忙活半天。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-04-12 12:05:56
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