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【求助】如果理论计算和实验结论相反,您会怎么办?!抓狂ing
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yjcmwgk
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[交流]
【求助】如果理论计算和实验结论相反,您会怎么办?!抓狂ing
各位高手好 我有个问题很痛苦
组里有个老师做了一个分子的CD谱
(注:该分子的手型不是由于手性碳引起的,而是由于它本身结构的扭曲而造成的CD信号)
为了给她提供实验支持 我就给她模拟CD啊
然后涅 这个分子有三个可能的构型(势能面上的三个局域最小点)
第一个构型能量=0 不出CD峰
第二个构型能量=3KJ/mol CD信号与实验相反
第三个构型能量=15KJ/mol CD信号与实验相同
可能的改进措施:
A 显式溶剂模型?(计算量太大)
B 隐式溶剂模型?(基本不抱期望,估计对各种构型的相对能量影响并不大,因为这位老师用的是非极性或弱极性溶剂)
C 找其他局域最小点?(我已经想破脑袋了,也想不出其他可能的局域最小点,难道这么大的分子让我scan?!?!)
D 实在无法可想了,我干脆本着“实践是检验真理的唯一标准”的原则,谁符合实验我就取谁,其他构型能量再低也不取信,拉倒,我不干了!
抓狂ing
请高手支招!!!谢谢高手们
[
Last edited by yjcmwgk on 2011-4-12 at 11:47
]
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
663181楼
:
Originally posted by
zhou2009
at 2011-04-13 08:23:15:
显式溶剂模型,是指在设计计算时,直接把溶质、溶剂分子构成一个分子体系来计算。隐式溶剂模型,是在GS输入文件中选择溶剂模型、指定溶剂品种,由GS自行进行溶剂影响的计算,而在计算结果中,这种溶剂并不会直 ...
周前辈,我有个疑问:对于显式溶剂模型,把溶质溶剂分子组合在一起,那如何确定该体系是处于气相状态还是液相状态呢?
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2012-04-18 16:55:27
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小红豆(金币+3): 感谢分享你的看法 常来 2011-04-12 13:09:20
yjcmwgk(金币+3): 2011-04-12 14:11:17
具体情况具体分析了,,有可能溶剂有作用,或者你的计算精度不够
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2011-04-12 11:51:26
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小红豆(金币+3): 感谢分享你的看法 2011-04-12 13:09:42
yjcmwgk(金币+3): 2011-04-12 14:11:22
给出多个方法和基组的结果,有可能能量次序不一样,导致结果也不一样。另外,能量最低的构型也有可能没找到
[
Last edited by 冬天里的骄阳 on 2011-4-12 at 11:58
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yjcmwgk(金币+3): 2011-04-12 14:11:27
虽然我不是很懂量化,但是可以考虑一些选择精度更好的方法,其次还需要验证试验是否准确,别试验做的是错的,你在这里瞎忙活半天。
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2011-04-12 12:05:56
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