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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

[交流] 【求助】如果理论计算和实验结论相反，您会怎么办？！抓狂ing

各位高手好我有个问题很痛苦
组里有个老师做了一个分子的CD谱
（注：该分子的手型不是由于手性碳引起的，而是由于它本身结构的扭曲而造成的CD信号）
为了给她提供实验支持我就给她模拟CD啊
然后涅这个分子有三个可能的构型(势能面上的三个局域最小点)
第一个构型能量=0 不出CD峰
第二个构型能量=3KJ/mol CD信号与实验相反
第三个构型能量=15KJ/mol CD信号与实验相同

可能的改进措施：
A 显式溶剂模型？（计算量太大）
B 隐式溶剂模型？（基本不抱期望，估计对各种构型的相对能量影响并不大，因为这位老师用的是非极性或弱极性溶剂）
C 找其他局域最小点？（我已经想破脑袋了，也想不出其他可能的局域最小点，难道这么大的分子让我scan？！？！）
D 实在无法可想了，我干脆本着“实践是检验真理的唯一标准”的原则，谁符合实验我就取谁，其他构型能量再低也不取信，拉倒，我不干了！

抓狂ing
请高手支招！！！谢谢高手们

[ Last edited by yjcmwgk on 2011-4-12 at 11:47 ]

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1楼 2011-04-12 11:44:45

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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 16 (小学生)
金币: 7420.2
帖子: 1438
在线: 610.9小时
虫号: 770403

★ ★
小红豆(金币+2): 感谢分享你的看法 2011-04-13 12:26:57

不清楚楼主所说的“相反”是什么意思....

小弟做计算的，也亲自做过CD谱...虽然对CD的原理不甚了解...

据我所知，CD谱的零点是在图谱的中间...上面为正下面为负，楼主所说的计算和实验相反可能是因为零点的选择不同引起的，如果把零点选在CD谱的最下方或最低点，则CD谱全部为正...

当然，这只是猜测，我不敢肯定能否这样选零点...