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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【讨论】amber输入文件的输写
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夏天的鱼

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】amber输入文件的输写已有2人参与

amber中，ptraj分析重原子和骨架原子的输入文件分别该怎么写呢？backbone atom 写成@CA，C, N对不对？heavy atom 该怎么写呢？各位高手指教一下~
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科研就是讨论出来的
1楼2011-04-12 10:37:45
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petersen

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
骨架原子和重原子有区别吗？请教！！
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2楼2011-04-13 14:11:09
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夏天的鱼

木虫 (小有名气)
★
御剑江湖(金币+1): 求助的自己回答问题了，哈哈，谢谢 2011-04-14 09:44:35
引用回帖:
Originally posted by petersen at 2011-04-13 14:11:09:
骨架原子和重原子有区别吗？请教！！

除了氢原子身下的都是重原子，包括侧链，而骨架原子不包括
赞一下(1人) 回复此楼
科研就是讨论出来的
3楼2011-04-14 08:23:36
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