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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【求助】求助C-H...O的氢键怎么编辑到Cif文件中
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30907017

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求助C-H...O的氢键怎么编辑到Cif文件中

想写一篇文章  需要C-H...O的氢键信息   但是没有编辑过这种氢键信息  请各位大侠指点一二 不胜感激
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1楼 2011-04-10 14:41:12
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30907017

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hqzhang at 2011-04-10 17:00:04:
直接在下面加上即可，给你个例子
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_ge ...

小妹想发一篇有机物的ACTA E   我看上面的文章都讨论C---H...O的氢键问题啦  敢问大侠怎么找到这种C---H...O氢键的信息，比如距离   角度   以及对称操作码
请大侠指点   小妹不胜感激
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3楼2011-04-10 21:11:24
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hqzhang

铁杆木虫 (著名写手)
直接在下面加上即可，给你个例子
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
C3 H3 O2  0.93 2.64 3.5290(20) 160.5 1_455
C9 H9 O1  0.93 2.64 3.4962(19) 152.7 4_475
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2楼2011-04-10 17:00:04
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hqzhang

铁杆木虫 (著名写手)
在platon中 计算这些C---H...O键，会给出详细信息，不过有的时候对称代码不准需要在XP中检查
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4楼2011-04-11 10:34:10
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