| 查看: 3168 | 回复: 12 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助完结】Linux系统下MS5.5的并行计算调度问题
|
|||
|
先介绍下我们课题组，太原理工大学 煤科学重点实验室 王宝俊教授 详细见：http://qcc.tyut.edu.cn/ 我们以前是在window下使用MS，新买了VASP，同时购买了3台32核的服务器（Linux），并行计算。 现在我使用的是Linux系统下的MS5.5。遇到一些问题，如下： 当我在提交一个任务96个核，3台能很好的分配运行。 当我提交6个任务，每个任务8核，48个核都在第一台上算，有6个核没自动分配到第二台运行。这样效率很低，第二三台就空着呢。 怎么才能使48核的任务，32核在第一台，剩下16核在第二台算，如何设置？ 我们有曙光调度系统，如图，这个能解决问题不？ 问题没解决啊，看来等下次培训时再看吧。    [ Last edited by slz0811 on 2011-4-25 at 19:26 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
今天务委会开完了，明天出结果吗
已经有22人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？
已经有19人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有3人回复
-
在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。
已经有9人回复
-
明天应该可查了！？
已经有6人回复
-
有没有大神帮我看看基金代码
已经有10人回复
-
放榜前的不淡定
已经有19人回复
-
某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感
已经有10人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有23人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- linux DMol3并行计算为什么不输出热力学性质
已经有6人回复
- linux系统安装过程中出问题，急求高手指教！
已经有4人回复
- 大家好，MS5.0在linux安装完后怎样start运行啊？？
已经有3人回复
- 【求助完成】Linux下安装MS5.5遇到问题
已经有4人回复
- 【求助】Linux下安装MS5.5 cluster
已经有10人回复
- 急求：windos和linux系统间的文件转换问题？
已经有3人回复
- 【求助】MS在Linux下的并行计算问题
已经有5人回复
- 【求助】能同时在linux系统下安装g09和g03吗？
已经有14人回复
- 【原创】64位linux5.4下安装MS5.0全过程及MS linux原文件lic文件（已搜索，无重复）
已经有43人回复
- 【求助】MS在LINUX下的安装问题
已经有22人回复
8楼2011-04-09 11:28:00
★ ★
slz0811(金币+20): 谢谢指点！ 2011-04-08 13:41:59
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-04-08 14:31:48
slz0811(金币+20): 谢谢指点！ 2011-04-08 13:41:59
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-04-08 14:31:48
|
没怎么用过MS，就说怎么通过MS建模导出vasp的POSCAR吧 在MS下建好模型，点击Modules->CASTEP->Files->save Files 然后在我的文档->Materials Studio Projects中进入所对应的project，比如名字是aaa，则进入aaa Files->Documents->xxx CASTEP Energy，然后打开这个名为xxx的cell文件，这里xxx是你结构的名字。注意这个文件是隐藏文件 然后根据vasp的格式修改该这个文件就可以用作POSCAR vasp其他输入文件与ms没有关系，自己写就可以 [ Last edited by sunyang1988 on 2011-4-8 at 13:43 ] |
2楼2011-04-08 13:31:59
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-04-08 14:47:54
slz0811(金币+60): 谢谢指点。 2011-04-08 15:10:57
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-04-08 14:47:54
slz0811(金币+60): 谢谢指点。 2011-04-08 15:10:57
|
你的前两个问题应该是差不多的，ms如果你要跨节点计算，最好使用作业调度系统，MS好像对gridview调度系统不是很支持，当然你用脚本的话应该可以，像你说的6个8核的作业提交上后都在第一个节点算就是这个原因，并且你的第一个节点的6个作业可能占用PCU都不到100%。 关于脚本，最好咨询一下曙光的工程师或是参考一些曙光的作业调度系统的一些模板，然后根据你自己的需要，网上也有一些ms作业的模板的，可以参考一下，比如下面的 http://www.linuxidc.com/Linux/2011-01/31234p2.htm 不过需要自己修改一下 最后一个，没有说ms的设置直接转化为VASP的输入这么一说，要是可以这样，大家都多省事，软件不同，设置的参数也会不同的，不是简单的转化就可以的，一般提供的转化也就停留在数据格式的转化上，也就是坐标文件的转化上，VASP的输入还是建议自己摸索一下，对你以后的计算很有帮助的，楼上的就是告诉你如何做POSCAR的过程，站内关于VASP的输入有很多讨论，可以看看，或许对你有帮助 最后祝你早日解决: ) |
3楼2011-04-08 14:43:31
4楼2011-04-08 14:59:31
28