应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】cDNA的内参照引物选择问题？
31/1返回列表
查看: 799  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

waldenpond

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】cDNA的内参照引物选择问题？

cDNA和DNA不一样，cDNA在逆转录的时候根据RNA的序列，去掉了许多内含子序列。
这样，根据DNA设计的引物在用作cDNA引物的时候，将cDNA扩增，出来的目的条带就有可能和DNA扩增出来的目的条带不一样，有可能因为cDNA缺少一些内含子序列而比预期的小。

这样的话，怎样设计cDNA的引物啊？

我PCR的时候选了一个内参照引物，本来文献上说扩增出的内参产物分子量是330bp，可实际我跑出来的只有290-300bp。
这该如何是好啊？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-04-06 19:09:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★ ★ ★
waldenpond(金币+2): 又见大侠，呵呵！我还是不太懂，明天问问老师去。 2011-04-06 19:29:54
dhd997(金币+3): good 2011-04-07 08:07:06
找到你的内参基因的cDNA序列或者mRNA序列再设计引物呗。先去NCBI搜一下序列吧。话说，330bp和300bp的区别很小，跑一般的琼脂糖胶再和maker比也未必准确的。marker的buffer和PCR的buffer有差异，有时会导致大小有差异。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-04-06 19:25:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励交流 2011-04-07 08:07:33
楼主可以直接根据cDNA序列设计引物！
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-06 21:39:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 waldenpond 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭