应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 【求助】用qst3算过渡态前需要对应三方面的原子序数，大家有什么好的经验没有
81/1返回列表
查看: 1745  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

书万里

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】用qst3算过渡态前需要对应三方面的原子序数，大家有什么好的经验没有

初次寻找过渡态，用qst3时，感觉对应甲基上的氢原子十分困难。我是用gv打开三个分子后后一个个对应。不知大家是怎样做的，万望赐教。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-04-01 21:41:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aimonkey

金虫 (正式写手)
★
书万里(金币+1):谢谢参与
书万里(金币+4): 金币虽少，谨表我心。首次问的三个问题都是兄弟你回答的。 2011-04-03 19:37:50
你的三个分子的顺序是怎样的
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-04-03 16:58:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pfabc0826

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
1.用GV绘出过渡态的构型（gjf文件），保存一下。
2.打开刚刚的过渡态文件，调整到初始构型和产物构型分别保存为gjf，这样就得到3个gjf文件。
3.以初始构型的gjf文件为基础依次将过渡态和产物构型复制粘贴过来（粘贴时选第一项），这样三个构型应该有一致的编号了。然后在执行calcualte---------gaussian calculation setup...进行设置保存即可。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-25 22:26:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jjww0001

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by aimonkey at 2011-04-03 16:58:05:
你的三个分子的顺序是怎样的

是否输入分子的次序对过渡态优化有很大的影响？我输入构型的次序一般是反应物、产物、过渡态。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-04-26 07:01:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yemiaoqiang

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by pfabc0826 at 2011-04-25 22:26:51:
1.用GV绘出过渡态的构型（gjf文件），保存一下。
2.打开刚刚的过渡态文件，调整到初始构型和产物构型分别保存为gjf，这样就得到3个gjf文件。
3.以初始构型的gjf文件为基础依次将过渡态和产物构型复制粘贴过来（ ...

但是，反应物和产物不是要经过优化吗？您这样，会不会有影响啊？我不是很懂，谢谢！
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-04-27 21:37:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

recoli

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
三个态的结构不都是你自己画出来的吗，从最开始的时候注意保持一致就行了。

如果开始嫌麻烦，反应物画一下，产物另外画一下，那后面要对应起来就要花更多精力了。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-04-28 04:50:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

书万里

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2011-04-28 04:50:03:
三个态的结构不都是你自己画出来的吗，从最开始的时候注意保持一致就行了。

如果开始嫌麻烦，反应物画一下，产物另外画一下，那后面要对应起来就要花更多精力了。

好   明白。真是这样
回复此楼
7楼2011-04-28 09:24:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
用UltraEdit分别打开三个文件（产物，过渡态，产物），然后把分子坐标部分复制粘贴到EXCEL中，对原子名称做按字母名称排列，然后再把排序好的分子坐标粘贴回输入文件中。至少我是这么做的。
赞一下 回复此楼
8楼2012-10-19 10:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 书万里 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭