24小时热门版块排行榜    

查看: 763  |  回复: 8

memgr

铜虫 (正式写手)


[交流] 【求助】box shifted!!!???/

想请教一下在跑动力学时提示错误 Box was shifted at least 10 times. 这是为什么呢 希望各位高手能够指点一二 在下不胜感激,谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)


怎么没人 自己既顶一个
2楼2011-03-17 08:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吕倩茹

银虫 (初入文坛)


memgr(金币+1): 2011-03-23 22:39:08
我在跑NPT的时候也经常遇到楼主相同这种问题,求解啊?
3楼2011-03-17 16:54:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)


对啊  但是不知道为什么啊  是不是格子建的有点小啊
4楼2011-03-17 19:37:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吕倩茹

银虫 (初入文坛)


我觉得不是,我每次都是调节cut-off值和耦合系数,但每次都觉得很随机,今天用了一下退火,算是可以跑下来了,不过还是不怎么好
5楼2011-03-17 20:45:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

manutdhk

木虫 (小有名气)


★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-18 14:10:33
memgr(金币+4): 2011-03-23 22:39:17
引用回帖:
Originally posted by memgr at 2011-03-16 21:15:54:
想请教一下在跑动力学时提示错误 Box was shifted at least 10 times. 这是为什么呢 希望各位高手能够指点一二 在下不胜感激,谢谢

box shift,按照个人经验,最有可能的是:box的重心在移动。也就是说 total linear momentum不等于零。这是用thermostat控制恒温经常出现的问题。
楼主不妨试一下:每次算完所有atom的速度之后,将linear momentum归零,看box是否稳定在原点。
6楼2011-03-18 01:54:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2011-03-18 01:54:56:
box shift,按照个人经验,最有可能的是:box的重心在移动。也就是说 total linear momentum不等于零。这是用thermostat控制恒温经常出现的问题。
楼主不妨试一下:每次算完所有atom的速度之后,将linear mome ...

谢谢  但是不明白你说的  由于偶是新手,不知道怎么操作 能够具体指点一下吗 谢谢
7楼2011-03-18 09:24:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

manutdhk

木虫 (小有名气)


★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-22 12:21:40
引用回帖:
Originally posted by memgr at 2011-03-18 09:24:28:
谢谢  但是不明白你说的  由于偶是新手,不知道怎么操作 能够具体指点一下吗 谢谢

我不能肯定是不是linear momentum的问题,但是你可以试一下。

随便google一下,MD, linear momentum zero,都可以得到答案了。或者随便找一本md的书看看。
8楼2011-03-21 10:36:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2011-03-21 10:36:09:
我不能肯定是不是linear momentum的问题,但是你可以试一下。

随便google一下,MD, linear momentum zero,都可以得到答案了。或者随便找一本md的书看看。

谢谢 我试试  谢谢
9楼2011-03-23 22:38:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 memgr 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +4 349506619 2026-08-28 4/200 2026-08-29 22:41 by alongwaytogo
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 3/150 2026-08-29 21:35 by 4qO8zhfjr2AX
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:33 by 4qO8zhfjr2AX
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:33 by 4qO8zhfjr2AX
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-29 21:11 by 4qO8zhfjr2AX
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 20:07 by winsaint
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +5 gdd2018 2026-08-28 10/500 2026-08-29 14:10 by Jacob678
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:02 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 11:18 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见