24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 631  |  回复: 8

memgr

铜虫 (正式写手)


[交流] 【求助】box shifted!!!???/

想请教一下在跑动力学时提示错误 Box was shifted at least 10 times. 这是为什么呢 希望各位高手能够指点一二 在下不胜感激,谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)


怎么没人 自己既顶一个
2楼2011-03-17 08:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吕倩茹

银虫 (初入文坛)


memgr(金币+1): 2011-03-23 22:39:08
我在跑NPT的时候也经常遇到楼主相同这种问题,求解啊?
3楼2011-03-17 16:54:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)


对啊  但是不知道为什么啊  是不是格子建的有点小啊
4楼2011-03-17 19:37:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吕倩茹

银虫 (初入文坛)


我觉得不是,我每次都是调节cut-off值和耦合系数,但每次都觉得很随机,今天用了一下退火,算是可以跑下来了,不过还是不怎么好
5楼2011-03-17 20:45:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

manutdhk

木虫 (小有名气)


★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-18 14:10:33
memgr(金币+4): 2011-03-23 22:39:17
引用回帖:
Originally posted by memgr at 2011-03-16 21:15:54:
想请教一下在跑动力学时提示错误 Box was shifted at least 10 times. 这是为什么呢 希望各位高手能够指点一二 在下不胜感激,谢谢

box shift,按照个人经验,最有可能的是:box的重心在移动。也就是说 total linear momentum不等于零。这是用thermostat控制恒温经常出现的问题。
楼主不妨试一下:每次算完所有atom的速度之后,将linear momentum归零,看box是否稳定在原点。
6楼2011-03-18 01:54:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2011-03-18 01:54:56:
box shift,按照个人经验,最有可能的是:box的重心在移动。也就是说 total linear momentum不等于零。这是用thermostat控制恒温经常出现的问题。
楼主不妨试一下:每次算完所有atom的速度之后,将linear mome ...

谢谢  但是不明白你说的  由于偶是新手,不知道怎么操作 能够具体指点一下吗 谢谢
7楼2011-03-18 09:24:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

manutdhk

木虫 (小有名气)


★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-22 12:21:40
引用回帖:
Originally posted by memgr at 2011-03-18 09:24:28:
谢谢  但是不明白你说的  由于偶是新手,不知道怎么操作 能够具体指点一下吗 谢谢

我不能肯定是不是linear momentum的问题,但是你可以试一下。

随便google一下,MD, linear momentum zero,都可以得到答案了。或者随便找一本md的书看看。
8楼2011-03-21 10:36:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

memgr

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2011-03-21 10:36:09:
我不能肯定是不是linear momentum的问题,但是你可以试一下。

随便google一下,MD, linear momentum zero,都可以得到答案了。或者随便找一本md的书看看。

谢谢 我试试  谢谢
9楼2011-03-23 22:38:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 memgr 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂325分 +13 15771691647 2026-04-04 15/750 2026-04-09 16:55 by 15771691647
[考研] 314求调剂 +20 wakeluofu 2026-04-09 21/1050 2026-04-09 16:14 by zhuimr
[考研] 化学调剂求助 +14 LULONG1 2026-04-03 19/950 2026-04-09 10:43 by chenxi233
[考博] 材料方向考博,求推荐 +3 言语aaa 2026-04-05 4/200 2026-04-08 22:22 by nxgogo
[考研] 274求调剂求调剂 +10 Jachenbingoo 2026-04-06 13/650 2026-04-08 14:25 by zhq0425
[考研] 生物学363调剂求助 +7 fanzhang6666 2026-04-06 9/450 2026-04-07 17:37 by lijunpoly
[考研] 315求调剂 +3 TUZEIQAQ 2026-04-02 3/150 2026-04-07 17:32 by chenp123
[考研] 生物学学硕求调剂:351分一志愿南京师范大学生物学专业 +6 …~、王…~ 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:54 by macy2011
[考研] 生物与医药求调剂 +7 heguanhua 2026-04-05 8/400 2026-04-06 18:41 by macy2011
[考研] 一志愿安徽某211 0703化学总分339求调剂 +7 晚风不晚 2026-04-04 7/350 2026-04-06 14:06 by houyaoxu
[考研] 346分的生物与医药08600求调剂 +6 常雨阳上岸 2026-04-05 7/350 2026-04-06 12:36 by lys0704
[考研] 332求调剂 +17 小小孟... 2026-04-05 18/900 2026-04-06 09:51 by 蓝云思雨
[考研] 272求调剂 +4 电气李 2026-04-05 4/200 2026-04-05 10:41 by lbsjt
[考研] 男生,一志愿沪9生物学071000,初试308求调剂 +3 刘墨墨 2026-04-04 3/150 2026-04-05 08:26 by barlinike
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +6 cs0106 2026-04-03 6/300 2026-04-04 11:20 by w_xuqing
[考研] 材料专业383求调剂 +8 郭阳阳阳成 2026-04-03 8/400 2026-04-04 10:29 by Rednal.
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-03 16:46 by wxiongid
[考研] 338求调剂 +4 zzz,,r 2026-04-03 4/200 2026-04-03 16:39 by lijunpoly
[考研] 工科341分调剂 +3 洛多罗 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:20 by 1753564080
[硕博家园] 求老师收留 +9 lllq123 2026-04-03 9/450 2026-04-03 13:48 by 呼吸都是减肥
信息提示
请填处理意见