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【求助】box shifted!!!???/
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memgr
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【求助】box shifted!!!???/
想请教一下在跑动力学时提示错误 Box was shifted at least 10 times. 这是为什么呢 希望各位高手能够指点一二 在下不胜感激,谢谢
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2011-03-16 21:15:54
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怎么没人 自己既顶一个
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2011-03-17 08:54:26
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吕倩茹
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memgr(金币+1): 2011-03-23 22:39:08
我在跑NPT的时候也经常遇到楼主相同这种问题,求解啊?
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3楼
2011-03-17 16:54:30
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对啊 但是不知道为什么啊 是不是格子建的有点小啊
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4楼
2011-03-17 19:37:25
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吕倩茹
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我觉得不是,我每次都是调节cut-off值和耦合系数,但每次都觉得很随机,今天用了一下退火,算是可以跑下来了,不过还是不怎么好
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5楼
2011-03-17 20:45:15
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ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-18 14:10:33
memgr(金币+4): 2011-03-23 22:39:17
引用回帖:
Originally posted by
memgr
at 2011-03-16 21:15:54:
想请教一下在跑动力学时提示错误 Box was shifted at least 10 times. 这是为什么呢 希望各位高手能够指点一二 在下不胜感激,谢谢
box shift,按照个人经验,最有可能的是:box的重心在移动。也就是说 total linear momentum不等于零。这是用thermostat控制恒温经常出现的问题。
楼主不妨试一下:每次算完所有atom的速度之后,将linear momentum归零,看box是否稳定在原点。
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6楼
2011-03-18 01:54:56
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memgr
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Originally posted by
manutdhk
at 2011-03-18 01:54:56:
box shift,按照个人经验,最有可能的是:box的重心在移动。也就是说 total linear momentum不等于零。这是用thermostat控制恒温经常出现的问题。
楼主不妨试一下:每次算完所有atom的速度之后,将linear mome ...
谢谢 但是不明白你说的 由于偶是新手,不知道怎么操作 能够具体指点一下吗 谢谢
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7楼
2011-03-18 09:24:28
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★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-22 12:21:40
引用回帖:
Originally posted by
memgr
at 2011-03-18 09:24:28:
谢谢 但是不明白你说的 由于偶是新手,不知道怎么操作 能够具体指点一下吗 谢谢
我不能肯定是不是linear momentum的问题,但是你可以试一下。
随便google一下,MD, linear momentum zero,都可以得到答案了。或者随便找一本md的书看看。
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8楼
2011-03-21 10:36:09
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引用回帖:
Originally posted by
manutdhk
at 2011-03-21 10:36:09:
我不能肯定是不是linear momentum的问题,但是你可以试一下。
随便google一下,MD, linear momentum zero,都可以得到答案了。或者随便找一本md的书看看。
谢谢 我试试 谢谢
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9楼
2011-03-23 22:38:42
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