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xiaowuxian

新虫 (初入文坛)

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注册: 2011-02-25
专业: 化学计量学与化学信息学

[交流] 【求助】无法用amber生成.out文件已有2人参与

为什么我用amber进行模拟的时候老是无法生成.out文件啊，请高手指点，拜托了
我的命令是
sander -O -i heat1.in -p tc.prmtop -c min.rst -r heat1.rst -o heat1.out -x heat1.mdcrd

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【求助】md跑几百步之后out文件出现NaN（无报错）已经有11人回复

1楼 2011-03-15 15:14:23

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

夏天的鱼

木虫 (小有名气)

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专业: 化学计量学与化学信息学

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-03-28 12:14:32

引用回帖:

Originally posted by xiaowuxian at 2011-03-15 15:14:23:
为什么我用amber进行模拟的时候老是无法生成.out文件啊，请高手指点，拜托了
我的命令是
sander -O -i heat1.in -p tc.prmtop -c min.rst -r heat1.rst -o heat1.out -x heat1.mdcrd

你打开那个错误的out文件。里面有提示