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baiyuefei

版主 (文学泰斗)


[交流] 【求助】Flack参数我怎么找不到呢?金币不是问题,帮帮我啊高手们?

Flack参数我怎么找不到呢?在那里?请高手们把找到后的Flack参数复制下让我看看,究竟在那里,为什么我一直找不到呢?(我的晶体结构有一个手性中心,我是拿混旋体培养的单晶,这个单晶的具体构型不知是R,S还是R和S的混合体),分子中只含有C,H,O,N,Br   MoK\a 方式测定。
如果没有Flack参数,但审稿人问我手性问题时我该怎么回答呢?急啊请高手帮帮我啊

LST文件如下
https://g.zhubajie.com/urllink.php?id=10772996qcw5fhr1g85ut9x8

cif文件如下
https://g.zhubajie.com/urllink.php?id=10772997ccjv1jdp84u97ob3

[ Last edited by baiyuefei on 2011-3-10 at 09:29 ]
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Nocturne

木虫 (正式写手)


baiyuefei(金币+5): 2011-03-10 08:07:30
CIF里面
2楼2011-03-09 23:07:36
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baiyuefei(金币+10): 2011-03-10 08:07:42
yunruirui(金币+1): 谢谢参与 2011-03-12 08:59:22
在解析完结构后产生的LST文件里面可以找到。例如下面的

3楼2011-03-09 23:13:23
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)


引用回帖:
Originally posted by linhua0402313 at 2011-03-09 23:13:23:
在解析完结构后产生的LST文件里面可以找到。例如下面的


可是我还没找到啊。LST我已经上传了,请您再帮我看一眼?
4楼2011-03-10 08:08:23
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)


引用回帖:
Originally posted by Nocturne at 2011-03-09 23:07:36:
CIF里面

具体哪项是啊?看了三遍也没看见Flack参数,cif已经上传,您再帮我看看
5楼2011-03-10 08:09:17
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★
baiyuefei(金币+1):谢谢参与
baiyuefei(金币+19): 2011-03-10 08:32:18
yunruirui(金币+1): 谢谢参与 2011-03-12 08:59:51
_symmetry_space_group_name_H-M    'C 2/c'不是手性群,
所以没有FLACK参数。
6楼2011-03-10 08:13:19
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)


引用回帖:
Originally posted by etongtong at 2011-03-10 08:13:19:
_symmetry_space_group_name_H-M    'C 2/c'不是手性群,
所以没有FLACK参数。

朋友,您好。
我的晶体结构有一个手性中心,我是拿混旋体培养的单晶,这个测得出来单晶的具体构型不知是R,S还是R和S的混合体,所以我想看看它的Flack参数,怎么会没有呢?请高手指教,无以未报,只能发金币表谢意了
7楼2011-03-10 08:34:12
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)


引用回帖:
Originally posted by etongtong at 2011-03-10 08:13:19:
_symmetry_space_group_name_H-M    'C 2/c'不是手性群,
所以没有FLACK参数。

您好,我还有个单晶也是拿混旋体培养的,测得的单晶我也不知道是R,S还是R和S混合体呢?想看看它的Flack参数是多少
它的:

_symmetry_cell_setting            Trigonal
_symmetry_space_group_name_H-M    R-3
_symmetry_space_group_name_Hall   '-R 3'

这个晶体有Flack参数吗?我也一直没找到啊?请高手解惑,要毕业了愁 ,还请高手帮帮小弟啊
8楼2011-03-10 08:38:07
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)


引用回帖:
Originally posted by etongtong at 2011-03-10 08:13:19:
_symmetry_space_group_name_H-M    'C 2/c'不是手性群,
所以没有FLACK参数。

当时我培养晶体时,确定是拿消旋体培养的,养出来后就测定。我也不知道测定的这个晶体具体是什么构型,不过肯定是R?S?或R和S的混合体,那怎么会没有Flack参数呢?还请高手帮帮我啊
9楼2011-03-10 08:42:26
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baiyuefei(金币+20): 2011-03-10 09:27:36
yunruirui(金币+1): 谢谢参与 2011-03-12 09:00:43
引用回帖:
Originally posted by baiyuefei at 2011-03-10 08:38:07:
您好,我还有个单晶也是拿混旋体培养的,测得的单晶我也不知道是R,S还是R和S混合体呢?想看看它的Flack参数是多少
它的:

_symmetry_cell_setting            Trigonal
_symmetry_space_group_name_H-M  ...

这个是有心的空间群,所以没有flack参数,只有无心的才有,你可以查看230个空间群表,上面有对应的空间群和对应的中心、手性和无心的备注
11楼2011-03-10 09:20:47
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)



baiyuefei(金币+15): 请问高手,我培养时化合物确有个手性中心,未经拆分的。但单晶测试是R,S还是R和S的混合体我就就不知道了。审稿人问我手性问题时我该怎么回答呢?急啊请高手帮帮我啊 2011-03-10 09:27:27
yunruirui(金币+1): 谢谢参与 2011-03-12 09:01:42
引用回帖:
Originally posted by baiyuefei at 2011-03-10 08:42:26:
当时我培养晶体时,确定是拿消旋体培养的,养出来后就测定。我也不知道测定的这个晶体具体是什么构型,不过肯定是R?S?或R和S的混合体,那怎么会没有Flack参数呢?还请高手帮帮我啊

R-3好象是中心对称群吧,晶体不是手性的,但结构里有一个手性C17是R型的。
12楼2011-03-10 09:23:57
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baiyuefei

版主 (文学泰斗)


引用回帖:
Originally posted by linhua0402313 at 2011-03-10 09:20:47:
这个是有心的空间群,所以没有flack参数,只有无心的才有,你可以查看230个空间群表,上面有对应的空间群和对应的中心、手性和无心的备注

请问高手,我培养时化合物确有个手性中心,未经拆分的。但单晶测试是R,S还是R和S的混合体我就就不知道了。审稿人问我手性问题时我该怎么回答呢?急啊请高手帮帮我啊
13楼2011-03-10 09:26:11
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


★ ★
baiyuefei(金币+1):谢谢参与
baiyuefei(金币+10): 2011-03-11 20:24:05
yunruirui(金币+1): 谢谢参与 2011-03-12 09:01:31
引用回帖:
Originally posted by yytsnake at 2011-03-10 09:23:57:
R-3好象是中心对称群吧,晶体不是手性的,但结构里有一个手性C17是R型的。

化合物是否有手性好象应该做其它的性质测试来验证吧。如果是看一下哪个原子是R还是S,好象是用左右规则手来判断吧。若太多,一时找不全,可以看一下CHECKCIF的结果,好象是在G类警告里。比如:
PLAT793_ALERT_4_G The Model has Chirality at C14     (Verify) ....          R      
PLAT793_ALERT_4_G The Model has Chirality at C26     (Verify) ....          S      
PLAT793_ALERT_4_G The Model has Chirality at C28     (Verify) ....          R      
PLAT793_ALERT_4_G The Model has Chirality at C30     (Verify) ....          S      
PLAT793_ALERT_4_G The Model has Chirality at C33     (Verify) ....          R      
检查结果提示某些原子有手性,并请求以其它物理方法加以验证。
纯属照书抄的,请勿见笑。
14楼2011-03-10 20:24:32
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)



baiyuefei(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by baiyuefei at 2011-03-10 09:26:11:
请问高手,我培养时化合物确有个手性中心,未经拆分的。但单晶测试是R,S还是R和S的混合体我就就不知道了。审稿人问我手性问题时我该怎么回答呢?急啊请高手帮帮我啊

你可以先做个VCD看是否是手性分子,然后按概率跳出20个晶体分别作CD鉴别,就可以大概R和S的比率,个人鄙见,以前有学生这个做过
19楼2011-03-12 09:04:01
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swimyan

新虫 (小有名气)


帮你顶一下
22楼2011-03-15 09:15:08
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wzgynkmlhf

金虫 (著名写手)



baiyuefei(金币+1):谢谢参与

楼主不仔细看看? 3楼都给出来了。
23楼2011-03-15 17:18:02
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
这个FLACK参数问题,涉及到的概念比较多,这里一下讲不清楚。
你可以这样理解:
1 没有FLACK参数说明不是手性群
2 即使有此参数也要看是否有重原子,没有则没有意义,有才能讨论构型。
24楼2011-08-16 23:13:28
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简单回复
jiangxue8210楼
2011-03-10 08:54   回复  
baiyuefei(金币+1):谢谢参与
icemine15楼
2011-03-10 20:38   回复  
baiyuefei(金币+1):谢谢参与
swimyan16楼
2011-03-11 12:01   回复  
baiyuefei(金币+1):谢谢参与
talk2csq17楼
2011-03-11 14:59   回复  
baiyuefei(金币+1):谢谢参与
2011-03-11 22:42   回复  
baiyuefei(金币+1):谢谢参与
2011-03-12 09:48   回复  
baiyuefei(金币+1):谢谢参与
swimyan21楼
2011-03-14 11:27   回复  
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