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jinglz

铁虫 (初入文坛)

[交流] 求助RT-PCR实验经验

求助!!
RT-RCR实验老是失败.
希望有心同仁能指点一二,不胜感激!!!
实验条件如下:
cDNA第一链合成
方法采用Promega公司的M-MLV反转录cDNA合成系统
反转录体系采用2ugRNA
根据上述定量结果,1号样品取2ul,2号样品取1ul加入消过毒的离心管中,每管中提加入2ulOligo(dt)15。70℃,加热5min。立即在冰上冷却试管,简单离心使管底溶液聚集。
再按顺序依次加入下列组分.
M-MLV 5X Reaction Buffer      5μl
dATP, 10mM                  1.25μl
dCTP, 10mM                  1.25μl
dGTP, 10mM                  1.25μl
dTTP, 10mM                  1.25μl
RNasin抑制剂                 25 units
M-MLV RT                   200 units
去离子水最终体积             25μl
轻弹管子混匀, 42℃孵育60min。
反应结束后,99℃加热5min,反转录酶失活。冷却。
(2) PCR扩增反应
为了确定最适的反应条件,选用了不同的反应体系(如下所示)
PCR条件: 95 ℃、90 s, 95 ℃、1 min,56 ℃、1 min 和72 ℃、2min,共25个循环次数,最终的延长是在 72 ℃ 、 7 min ,样品在4 ℃孵育直至分析。
PCR产物鉴定
取10ulPCR产物,用1%琼脂糖凝胶快速电泳,EB染色,紫外灯下观察条带。
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2楼2006-08-16 16:37:05
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zhyl1984

金虫 (正式写手)

是不是你自己基因引物设计不合理啊
3楼2006-08-16 17:23:27
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jinglz

铁虫 (初入文坛)

谢谢楼上回复!引物与参考文献上一致啊!
4楼2006-08-17 09:08:55
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anya2004

★ ★
jinglz(金币+1):谢谢答复
wsshihan(金币+1):感谢参与!欢迎常来作客~
是没有条带吗?
可能原因:
1 你提的RNA有没有降解
2退火温度偏高
3 文献中引物也有可能错误,你用BLAST 比对了吗
4PCR仪有没有问题
5楼2006-08-17 23:51:35
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