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zhangyu08

铜虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】请大家帮忙看看这篇文献的环氧树脂的模型是怎么建的？

我根据附件中（http://good.gd/1031395.htm或者直接从学术期刊网上下题目：环氧树脂的分子模拟研究）的文献来建交联的环氧树脂模型，先把文献29页的步骤贴下面啊，方便大家讨论。
步骤一:基于一个原子一个原子的方式建立DGEBA和IPD的小分子单体的二维活性结构模型。分别对这两个模型进行能量优化以获得合理的三维结构。并用QEq方法[31]分配原子的局部电荷。移除末端官能基团上的活性氢，剩下含有碳或氮反应位点的分子片段（下称作反应性分子片段）用于下一步。“原始的”、“活性的”
和“反应性”官能基团的模型化如图2.7所示。
步骤二:将16个“反应性”的DGEBA分子片段和8个反应性的IPD分子片段放入预先定义好的三维盒子内（选定的盒子尺寸对应的密度值为1.131 g/cm3）。所用
的方法是Theodorou和Suter[2]提出的“随机自避行走”方法，这个算法在Cerius2分子模拟软件的Amorphous Builder模块中执行。为了排除边界效应和使得模型更
“实际”，在立方元胞盒子上强加了周期边界条件。产生的模型系统用来代表树脂
组分和固化剂组分在化学计量比1:1（官能团的数目比）下初始的物理熔融混物。
本来想把图片也贴上来的，但是不知道怎么弄？复制粘贴不好使。

步骤一中的原子模型我都建完了，其中移除末端官能团上的活性氢，我的理解是指把氢删掉，但是我删完了之后用amorphous cell 建步骤二的三维盒子时，失败，提示原因是：力场不对。文献中作者用的力场是dreiding,版本是MS4.0；我用的是版本MS4.3，力场compass.（我使用的软件amorphous cell 模块没有dreiding这个力场）
不知道是我对文献的理解不对还是哪操作错误了，请各位牛人帮忙指导一下，谢谢。

[ Last edited by zhangyu08 on 2011-3-8 at 16:48 ]

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1楼 2011-03-08 16:43:27

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zhangyu08(金币+1):谢谢参与
zhangyu08(金币+1): 2011-03-09 15:44:31
zhangyu08(金币+1): 2011-04-11 13:54:45

引用回帖:

Originally posted by zhangyu08 at 2011-03-08 16:43:27:
我根据附件中（http://good.gd/1031395.htm或者直接从学术期刊网上下题目：环氧树脂的分子模拟研究）的文献来建交联的环氧树脂模型，先把文献29页的步骤贴下面啊，方便大家讨论。
步骤一:基于一个原子 ...

作者用的不是ms吧？