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【求助】请大家帮忙看看这篇文献的环氧树脂的模型是怎么建的?
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我根据附件中(http://good.gd/1031395.htm或者直接从学术期刊网上下题目:环氧树脂的分子模拟研究)的文献来建交联的环氧树脂模型,先把文献29页的步骤贴下面啊,方便大家讨论。 步骤一:基于一个原子一个原子的方式建立DGEBA和IPD的小分子单体的二维活性结构模型。分别对这两个模型进行能量优化以获得合理的三维结构。并用QEq方法[31]分配原子的局部电荷。移除末端官能基团上的活性氢,剩下含有碳或氮反应位点的分子片段(下称作反应性分子片段)用于下一步。“原始的”、“活性的” 和“反应性”官能基团的模型化如图2.7所示。 步骤二:将16个“反应性”的DGEBA分子片段和8个反应性的IPD分子片段放入预先定义好的三维盒子内(选定的盒子尺寸对应的密度值为1.131 g/cm3)。所用 的方法是Theodorou和Suter[2]提出的“随机自避行走”方法,这个算法在Cerius2分子模拟软件的Amorphous Builder模块中执行。为了排除边界效应和使得模型更 “实际”,在立方元胞盒子上强加了周期边界条件。产生的模型系统用来代表树脂 组分和固化剂组分在化学计量比1:1(官能团的数目比)下初始的物理熔融混物。 本来想把图片也贴上来的,但是不知道怎么弄?复制粘贴不好使。 步骤一中的原子模型我都建完了,其中移除末端官能团上的活性氢,我的理解是指把氢删掉,但是我删完了之后用amorphous cell 建步骤二的三维盒子时,失败,提示原因是:力场不对。文献中作者用的力场是dreiding,版本是MS4.0;我用的是版本MS4.3,力场compass.(我使用的软件amorphous cell 模块没有dreiding这个力场) 不知道是我对文献的理解不对还是哪操作错误了,请各位牛人帮忙指导一下,谢谢。 [ Last edited by zhangyu08 on 2011-3-8 at 16:48 ] |
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