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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】关于蛋白影响信号通路
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elaine596

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】关于蛋白影响信号通路

刚进实验室 想弱弱的请教大家一下 如何判断一个蛋白对通路中哪一个蛋白是上调作用 还有就是如果蛋白表达过量是否可以认为其RNA表达也过量
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1楼2011-03-03 13:54:27
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gongeleven

铁杆木虫 (正式写手)
elaine596(金币+2): 噢，想再问一下RTPCR引物设计要注意什么呢 2011-03-04 19:13:31
RNA水平和蛋白水平都要评估吧
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3楼2011-03-03 22:26:55
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冬虫夏草1

金虫 (小有名气)
elaine596(金币+2): 谢谢啊，麻烦还想问一下，如果想设计RTPCR引物，什么软件比较好呢？ 2011-03-04 19:11:41
蛋白的过量表达理应与RNA的过量表达有关。
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2楼2011-03-03 21:58:42
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冬虫夏草1

金虫 (小有名气)
elaine596(金币+2): 谢谢啊 2011-03-07 13:42:03
RT-PCR与PCR实质一样，用同样的软件就可以了。注意些细节就行了
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4楼2011-03-06 10:07:19
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lisa68320

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★
lstt09nk(金币+5): 感谢参与，欢迎交流 2011-03-06 11:11:04
elaine596(金币+5): 谢谢回帖，解答详细啊！想再问问关于RTPCR引物设计用什么软件好呢！ 2011-03-07 13:43:24
elaine596(金币+5): 谢谢 2011-04-25 18:05:24
如何判断一个蛋白对通路中哪一个蛋白是上调作用
A:我觉得如果你并没有明确的目标而是需要广谱的结果，那可以用蛋白质组学得到哪些蛋白被上调，如果只是想知道A蛋白对B蛋白是否有上调，只需要从gene水平和蛋白水平检测应该就可以了，如果是蛋白酶，可能还要检测一下活性会更好。

还有就是如果蛋白表达过量是否可以认为其RNA表达也过量
A:我觉得未必，因为蛋白质是处于细胞内庞大的network中，有可能这种蛋白的mRNA水平并没有变化，但是促进蛋白的活化或是帮助它合成的其他蛋白增加了，所以蛋白水平可能增加了。
这是我的看法，仅供参考
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5楼2011-03-06 10:42:57
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