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【求助】请问这个构型用ATK怎么构造呀？
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请问这个构型怎么用ATK构造呀？谢谢呀，先送上50个金币，如有需要，在添加。 |
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2楼2011-03-04 09:27:47
4楼2011-03-05 09:06:53
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢详细指导 2011-03-10 22:09:35
qnsyhanjiu(金币+50): 谢谢了，这个问题我已经解决了，在向你请教一个问题，就是如何把分子加到电极中我想要的位置呀？谢谢了！ 2011-03-11 16:16:28
zzy870720z(金币+2): 谢谢详细指导 2011-03-10 22:09:35
qnsyhanjiu(金币+50): 谢谢了，这个问题我已经解决了，在向你请教一个问题，就是如何把分子加到电极中我想要的位置呀？谢谢了！ 2011-03-11 16:16:28
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呵呵 MS有很多输入格式 其中一个是 ############ 22 C -1.777745515 -2.400590108 -2.995031451 C -1.757468884 -1.087438605 -3.504002591 C -1.649690043 0.002953698 -2.615787114 C -1.607767113 -0.268204570 -1.257439445 C -1.669375032 -1.573928904 -0.728739160 C -1.745734408 -2.651138846 -1.622998580 H -1.833684069 -3.248687132 -3.704887395 H -1.638939582 1.046590774 -2.989774537 H -1.796858327 -3.693361308 -1.247803012 C -1.652668588 -0.258090441 1.245841793 C -1.694163548 0.010718989 2.606694564 C -1.786162715 -1.080856382 3.495827083 C -1.809965641 -2.393708345 2.987639993 C -1.765017898 -2.644774204 1.617138092 C -1.688861051 -1.567769185 0.721920697 H -1.679117401 1.052936628 2.984284427 H -1.866792191 -3.239924161 3.699569958 H -1.792450873 -3.687972721 1.242283709 S -1.356973288 0.995739042 -0.011734104 O -2.404209668 2.057139153 -0.065058455 S -1.875373411 -0.720088841 -5.200077926 S -1.875220754 -0.719734529 5.195343452 ################################## 把上面的数据坐标放入文本文件中然后另存为 DBT.xyz 那么就可以把这个导入VNL了 1，点击Result Browser 点击Open 找到电脑DBT.xyz 文件 确定 那么就变成VNL的格式了 具体能不能帮到你 我就不知道了 |
5楼2011-03-10 15:16:01
6楼2011-03-11 16:19:57
★ ★
sunyang1988(金币+2): 谢谢指点 2011-03-12 11:01:08
qnsyhanjiu(金币+8): 谢谢了，有啥问题，在向你请教 2011-03-12 18:15:18
qnsyhanjiu(金币+10): 在向你请教一个问题 2011-03-14 10:48:08
sunyang1988(金币+2): 谢谢指点 2011-03-12 11:01:08
qnsyhanjiu(金币+8): 谢谢了，有啥问题，在向你请教 2011-03-12 18:15:18
qnsyhanjiu(金币+10): 在向你请教一个问题 2011-03-14 10:48:08
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电极是先建立好的 然后加入你的分子 1，以金（111）面电极为例 在Crystal Cupboard 中选择 Au 然后将右下角的 Drag。。。 拖入Atomic Manipulator 右键点击右侧黑色部分 Cleave 在 Surface 和Two-probe终不过设定 电极切面 电极大小 建立你想要的电极 2,如果你是在MolecularBulider中构造的分子 直接点击右下角图标 拖入 电极的黑色区域 分子就添加到坐标原点（000）然后通过平移选择将分子移动到电极合适的位置 如果是通过别的方法建立的分子 按照前面的帖子把它转成VNL的格式 复制于 Script Editor 然后拖入电极黑色区域 具体操作对照手册慢慢练习吧 |
7楼2011-03-12 10:36:48
简单回复
2011-03-04 10:01
回复
qnsyhanjiu(金币+1):谢谢参与
gzqdyouxia: 请勿纯表，谢谢您的理解和支持 2011-03-04 10:26:37
gzqdyouxia: 请勿纯表，谢谢您的理解和支持 2011-03-04 10:26:37
