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gaods101@163

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助】为什么运行vasp机器卡的厉害

各位同仁大家好!小弟初学vasp,可运行时就出现了问题,也不知道什么问题,我做的是层错的问题,移动原子前的文件是可以运行的,可移动后就不行了,机器卡的几乎动不了,我top了一下cpu几乎不工作,而内存全都用了!我想移动原子前后不一样的只有原子坐标不同啊,可为什么就不能运行呢?麻烦各位给我看看!下面是我的poscar:
Pure Cu
1
3.6147000000000  -3.614700000000  0.00000000000
0.0000000000000  3.6147000000000  -3.61470000000
15.412702691896  15.412702691896  15.412702691896
36
Direct
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        0.666666667        0.833333333        0.234527329
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        0.866666667        0.133333333        0.312703106
        0.366666667        0.633333333        0.312703106
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        0.033333333        -0.033333333          0.390878882
        0.533333333        -0.033333333          0.390878882
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        0.533333333        0.466666667        0.390878882
        0.200000000        0.300000000        0.469054659
        0.700000000        0.300000000        0.469054659
        0.200000000        0.800000000        0.469054659
        0.700000000        0.800000000        0.469054659
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        0.366666667        0.633333333        0.547230435
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        0.033333333        -0.033333333          0.625406212
        0.533333333        -0.033333333          0.625406212
        0.033333333        0.466666667        0.625406212
        0.533333333        0.466666667        0.625406212
INCAR是:
SYSTEM=Cu
ISTART=0
PREC=Accurate
ENCUT=273.2
ISYM=1
GGA=91
ISIF=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.1
NPAR=4
LPLANE=.TRUE.
麻烦帮我看看,谢谢!
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★ ★
ellsaking(金币+2): 写的很到位啊,哈哈 2011-02-28 18:50:03
引用回帖:
Originally posted by gaods101@163 at 2011-02-28 14:57:06:
各位同仁大家好!小弟初学vasp,可运行时就出现了问题,也不知道什么问题,我做的是层错的问题,移动原子前的文件是可以运行的,可移动后就不行了,机器卡的几乎动不了,我top了一下cpu几乎不工作,而内存全都用了 ...

你的机子什么配置呀?这么多原子,空间体积这么大,还用Accurate,再加上ISYM=1 低对称行,内存肯定大,你该一些参数吧,把要求降低点
2楼2011-02-28 17:30:37
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zzy870720z(金币+1): 谢谢指点 2011-02-28 19:53:56
引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-02-28 10:30:37:
你的机子什么配置呀?这么多原子,空间体积这么大,还用Accurate,再加上ISYM=1 低对称行,内存肯定大,你该一些参数吧,把要求降低点

内存用完了,几乎就卡死了。这个时候好像程序本身也跑不动了吧!
3楼2011-02-28 19:39:21
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gaods101@163

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-02-28 17:30:37:
你的机子什么配置呀?这么多原子,空间体积这么大,还用Accurate,再加上ISYM=1 低对称行,内存肯定大,你该一些参数吧,把要求降低点

可是在移动前,就这个设置算了不到半天就有结果了啊,移了原子后就跑不动了!
4楼2011-03-01 08:32:21
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gaods101@163

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-02-28 19:39:21:
内存用完了,几乎就卡死了。这个时候好像程序本身也跑不动了吧!

是跑不动,没移原子前也就七八个小时,移了之后一天也没结果
5楼2011-03-01 08:33:52
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gaods101@163

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-02-28 17:30:37:
你的机子什么配置呀?这么多原子,空间体积这么大,还用Accurate,再加上ISYM=1 低对称行,内存肯定大,你该一些参数吧,把要求降低点

不行,改了,还是卡,只有换成原来原子位置才行,所以感觉应该是POSCAR的原因,可又不知道问题出在哪里
6楼2011-03-01 08:38:18
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zxzbl

木虫 (著名写手)


,喜获100个金币特别高兴
7楼2011-03-01 08:49:12
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veryman

木虫 (正式写手)


★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指点 2011-03-01 11:50:40
gaods101@163(金币+10): 2011-03-02 08:38:43
gaods101@163(金币+5): 2011-03-03 11:02:39
移动了原子之后结构的对称性下降,通过对称性减少k点来减少的计算量在你移动原子之后就没了,也就是说计算时k点增加了很多,超过了你计算机内存能够承受的范围。。
8楼2011-03-01 09:00:11
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zzy870720z(金币+1): 谢谢参与讨论 2011-03-01 14:08:43
gaods101@163(金币+2): 2011-03-02 08:41:43
gaods101@163(金币+3): 2011-03-03 11:02:59
有几个问题:
首先看你的数据不像是优化后的,优化后的我从来没讲过你这么整齐的数据,其次你的体系中原子之间的距离太大,有些最近的大于3A,你的晶包基失可能有问题。估计你第一次优化没有收敛
9楼2011-03-01 13:00:50
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gaods101@163

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by veryman at 2011-03-01 09:00:11:
移动了原子之后结构的对称性下降,通过对称性减少k点来减少的计算量在你移动原子之后就没了,也就是说计算时k点增加了很多,超过了你计算机内存能够承受的范围。。

谢谢,我感觉应该是这个原因吧,因为我减少K点后,确实不卡了。
10楼2011-03-02 08:41:12
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gaods101@163

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-03-01 13:00:50:
有几个问题:
首先看你的数据不像是优化后的,优化后的我从来没讲过你这么整齐的数据,其次你的体系中原子之间的距离太大,有些最近的大于3A,你的晶包基失可能有问题。估计你第一次优化没有收敛

我想无论是优化还是自洽都必须计算,只要是计算就卡,所以,感觉你说的不是原因,但你提醒我,我确实忘了优化了,谢谢!
11楼2011-03-02 08:42:58
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