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【求助】在Discover中Minimize后如何进行后续Dynamic运算
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jeeanlee
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[交流]
【求助】在Discover中Minimize后如何进行后续Dynamic运算
本人需要先对系统进行dicover模块的Minimize优化,再对优化后的系统进行Dynamic动力学计算。
本人的操作过程为:通过SSH Secure Shell软件传送和提交任务,远程在计算中心服务器上进行了dicover模块中的Minimize运算,得到的结果文件中仅有*.cor,*.prm和*.out三个文件。其中*.cor文件中的系统结构已经进行了优化,而原有的*.car,*.xsd文件中的系统结构没有发生改变。
后续在已优化的*.cor文件上对系统进行dynamic运算,点击Files...时,Save Files是灰色不可用的,个人认为是这由于*.cor文件仅是一个系统坐标文件,无法针对其进行动力学计算,而应该对*.xsd进行计算,但优化后*.xsd文件中的系统结构并未改变。
请教各位,是否我的操作不正确?应该如何在远程服务器上进行Discover的minimize和dynamic运算?
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2011-02-28 09:08:26
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★
jeeanlee(金币+2): 谢谢参与
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6楼
:
Originally posted by
量化新手
at 2011-12-14 15:33:42
我也出现那种情况,输出的就只是car,cor文件,连*.prm都没有,看了他们的文件格式那些介绍,就感觉cor应该是输出结果的坐标文件,所以就用他另存问xsd文件用于后面的动力学模拟,也不知道这样对不对,楼主如果已经 ...
请问,MM后金星后续动力学,是把.cor另存为.xsd进行的吗?我也碰到了这样的问题,还请告知下,谢谢
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7楼
2017-03-08 16:42:59
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mountwar
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★
jeeanlee(金币
+2
):谢谢参与
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2楼
2011-02-28 14:42:12
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jeeanlee
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★
youzhizhe(金币+1): 作为lz与人帮助,谢谢交流。 2011-02-28 15:51:36
引用回帖:
Originally posted by
mountwar
at 2011-02-28 14:42:12:
请问你旁边的图是用什么构建的?是amorphous cell 的construction吗?
是的,是amorphous cell的construction建的
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3楼
2011-02-28 15:44:04
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syongui
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★ ★ ★
jeeanlee(金币
+2
):谢谢参与
zzy870720z(金币+2): 谢谢指点 2011-03-01 15:54:56
discover得到的是一个轨迹文件吧,应该是相应的能量点对应着相应的结构图,你看看是不是需要打开状态下才能找到优化后的结构,然后另存是一下1
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5楼
2011-03-01 15:29:42
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