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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】在Discover中Minimize后如何进行后续Dynamic运算
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jeeanlee

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】在Discover中Minimize后如何进行后续Dynamic运算

本人需要先对系统进行dicover模块的Minimize优化，再对优化后的系统进行Dynamic动力学计算。
    本人的操作过程为：通过SSH Secure Shell软件传送和提交任务，远程在计算中心服务器上进行了dicover模块中的Minimize运算，得到的结果文件中仅有*.cor，*.prm和*.out三个文件。其中*.cor文件中的系统结构已经进行了优化，而原有的*.car，*.xsd文件中的系统结构没有发生改变。
    后续在已优化的*.cor文件上对系统进行dynamic运算，点击Files...时，Save Files是灰色不可用的，个人认为是这由于*.cor文件仅是一个系统坐标文件，无法针对其进行动力学计算，而应该对*.xsd进行计算，但优化后*.xsd文件中的系统结构并未改变。
    请教各位，是否我的操作不正确？应该如何在远程服务器上进行Discover的minimize和dynamic运算？
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1楼2011-02-28 09:08:26
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syongui

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
jeeanlee(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+2): 谢谢指点 2011-03-01 15:54:56
discover得到的是一个轨迹文件吧，应该是相应的能量点对应着相应的结构图，你看看是不是需要打开状态下才能找到优化后的结构，然后另存是一下1
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5楼2011-03-01 15:29:42
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mountwar

禁虫 (小有名气)
★
jeeanlee(金币+2):谢谢参与
本帖内容被屏蔽
2楼2011-02-28 14:42:12
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jeeanlee

木虫 (正式写手)
★
youzhizhe(金币+1): 作为lz与人帮助，谢谢交流。 2011-02-28 15:51:36
引用回帖:
Originally posted by mountwar at 2011-02-28 14:42:12:
请问你旁边的图是用什么构建的？是amorphous cell 的construction吗？

是的，是amorphous cell的construction建的
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3楼2011-02-28 15:44:04
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量化新手

新虫 (正式写手)
★
jeeanlee(金币+2):谢谢参与
引用回帖:
1楼: Originally posted by jeeanlee at 2011-02-28 09:08:26:
本人需要先对系统进行dicover模块的Minimize优化，再对优化后的系统进行Dynamic动力学计算。
    本人的操作过程为：通过SSH Secure Shell软件传送和提交任务，远程在计算中心服务器上进行了dicover模块中的Mini ...

我也出现那种情况，输出的就只是car，cor文件，连*.prm都没有，看了他们的文件格式那些介绍，就感觉cor应该是输出结果的坐标文件，所以就用他另存问xsd文件用于后面的动力学模拟，也不知道这样对不对，楼主如果已经解决就请分享一下吧，不知道你解决得怎么样了，谢谢
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6楼2011-12-14 15:33:42
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