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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】linux下做频率计算报错，好像是内存问题。。
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】linux下做频率计算报错，好像是内存问题。。 已有5人参与

任务是
%chk=doac-c2h2.chk
%mem=8MW
%nproc=1
# freq mp2/6-311+g geom=connectivity
错误提示内存不够，至少10MW
我就改成了
%chk=doac-c2h2.chk
%mem=10MW
%nproc=1
# freq mp2/6-311+g geom=connectivity
但还是报错，错误信息是
Disk-based method using ON**2 memory for 36 occupieds at a time.
Permanent disk used for amplitudes=   136758412 words.
Estimated scratch disk usage=  1050267586 words.
Actual    scratch disk usage=  1045563330 words.
Not enough memory for best loop length:
LenScr=     3948334 LenERI=     3000000 MOrb=  36 NBasFn= 263
NDiv=   69169 NHalf=   51 MxRSFn=  16 RSMin=   51 GoodMem=    10055238
Increasing memory by up to     6106904 words may improve performance.
Not enough memory to run at all:  LenERI=     3000000
Increase memory by     1265074 words.
Error termination via Lnk1e in /home/program/g03/l906.exe at Sun Feb 27 12:38:13 2011.
Job cpu time:  0 days  0 hours  9 minutes 44.6 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   9113 Int=      0 D2E=      0 Chk=     13 Scr=      1
应该怎么解决呢，已经是在linux下计算了
诚求大家帮忙解决
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1楼 2011-02-27 12:52:45
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jjww0001

金虫 (小有名气)
★
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好像是说硬盘容量不够。10位数的words差不多是10g，不知道你硬盘是多大？尝试加上maxdisk=20g看看，另外看你的设置，好像机器不够强大啊，内存设置为什么不用mb呢，把所有空余的内存都设置到mem里（例如％mem=3000mb),我不熟悉1mw到底是多少兆内存,虽然gauss自己喜欢用mw。

[ Last edited by jjww0001 on 2011-2-27 at 14:08 ]
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2楼2011-02-27 14:03:47
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by jjww0001 at 2011-02-27 14:03:47:
好像是说硬盘容量不够。10位数的words差不多是10g，不知道你硬盘是多大？尝试加上maxdisk=20g看看，另外看你的设置，好像机器不够强大啊，内存设置为什么不用mb呢，把所有空余的内存都设置到mem里（例如％mem=300 ...

1MW等于8 兆
是曙光超级计算机。。。应该硬件没问题吧。。
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3楼2011-02-27 14:22:45
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)
别沉了，还没解决呢，大家帮帮忙
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4楼2011-02-27 20:31:16
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jjww0001

金虫 (小有名气)
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Originally posted by 小白如水 at 2011-02-27 14:22:45:
1MW等于8 兆
是曙光超级计算机。。。应该硬件没问题吧。。

超级机器为什么只用10mw内存呢？设置成3000mb吧，如果你有更多的内存的话可以设置更大一些。
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5楼2011-02-28 23:37:51
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zhengpc3505

金虫 (小有名气)
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Originally posted by 小白如水 at 2011-02-27 14:22:45:
1MW等于8 兆
是曙光超级计算机。。。应该硬件没问题吧。。

既然是超级计算机，只用这些点内存和一个CPU来进行mp2的计算，有点说不过去了
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6楼2011-03-01 01:18:55
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhengpc3505 at 2011-03-01 01:18:55:
既然是超级计算机，只用这些点内存和一个CPU来进行mp2的计算，有点说不过去了

刚开始接触量化，电脑好像是8个cpu。。。内存多少不知道。。因为是以前安装的，那时我还没进实验室。像MP2-6-311G+这种方法，内存和cpu设置成多少合适呢？ 体系是一个阴阳离子和一个中性分子构成的三分子体系，原子数50左右
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7楼2011-03-01 18:21:06
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zhengpc3505

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
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Originally posted by 小白如水 at 2011-03-01 18:21:06:
刚开始接触量化，电脑好像是8个cpu。。。内存多少不知道。。因为是以前安装的，那时我还没进实验室。像MP2-6-311G+这种方法，内存和cpu设置成多少合适呢？ 体系是一个阴阳离子和一个中性分子构成的三分子体 ...

50个原子的MP2/6-311G+估计你要用上所有的CPU和内存了
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8楼2011-03-01 20:44:22
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jjww0001

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 小白如水 at 2011-03-01 18:21:06:
刚开始接触量化，电脑好像是8个cpu。。。内存多少不知道。。因为是以前安装的，那时我还没进实验室。像MP2-6-311G+这种方法，内存和cpu设置成多少合适呢？ 体系是一个阴阳离子和一个中性分子构成的三分子体 ...

如果机器就自己一个人用的话，就用％nprco＝8，内存不知道多少就拆开look一下，如果很多人用机器又很忙的话，你这么大的体系也应该占2到4个cpu，内存干脆不设置算了，爱用多少用多少。
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9楼2011-03-02 16:08:35
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waehrend

至尊木虫 (知名作家)

水哥

优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
一般我都用300MW的内存 楼主你设置的太低了 你设置个至少200MW试试
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何三水，人称水哥（对啦，就是灌水的那个水啦）
10楼2011-03-02 19:56:23
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