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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】请牛人帮我解答下A， B 类错误
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shawcx

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请牛人帮我解答下A， B 类错误

刚把cif 文件pre-check 了一下，发现有3个A  类错误，4个B类错误，本人实在搞不懂，还请大牛们帮我看看主要是什么问题？严不严重？   
Alert level A
PLAT035_ALERT_1_A No _chemical_absolute_configuration info given .          ?
PLAT245_ALERT_2_A U(iso) H9A     Smaller than U(eq) O9      by ...       0.38 AngSq
PLAT245_ALERT_2_A U(iso) H9B     Smaller than U(eq) O9      by ...       0.31 AngSq
________________________________________
Alert level B
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O8     -   H8A    ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O9     -   H9A    ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O9     -   H9B    ...          ?      
PLAT731_ALERT_1_B Bond    Calc     0.96(7), Rep   0.968(10) ......       7.00 su-Ra
              O9   -H9B     1.555   1.555                    #         14
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1楼 2011-02-23 23:54:13
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shawcx

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2011-02-24 01:26:04:
H8a H9a H9b都加得不对，要重加。
然后不要修其坐标了， Ueq用 -1.5


比如 修改 .ins, 再修正

O8 4  x y z 11.0
AFIX 3
H8 2 x y z 11.0 -1.5
O9  x y z 11.0
AFIX 3
H9a 2 x y z 11.0 -1.5
h9b  ...

谢谢你了哈！

正在跟做晶体的老师联系看怎么处理。
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4楼2011-02-24 19:27:02
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jim5362

金虫 (正式写手)
本人也是新手，A类错误1，可以在_refine_ls_abs_structure_Flack    下面加一行
_chemical_absolute_configuration  ？，至于？填什么内容要根据你所做的研究内容。
请大侠指教指教
赞一下 回复此楼
2楼2011-02-24 00:17:41
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
shawcx(金币+5): 谢谢你的回复，虽然不太懂。 2011-02-24 19:28:41
H8a H9a H9b都加得不对，要重加。
然后不要修其坐标了， Ueq用 -1.5


比如 修改 .ins, 再修正

O8 4  x y z 11.0
AFIX 3
H8 2 x y z 11.0 -1.5
O9  x y z 11.0
AFIX 3
H9a 2 x y z 11.0 -1.5
h9b 2 x y z 11.0 -1.5
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3楼2011-02-24 01:26:04
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