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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】24个Mg原子，即hcp结构， 结果里面出现很大的warning，怎么回事
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hans201011

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】24个Mg原子，即hcp结构， 结果里面出现很大的warning，怎么回事 已有5人参与

24个Mg原子，即hcp结构， 结果里面出现很大的warning，
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1楼 2011-02-23 17:03:55
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bingmou

金虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1): 谢谢回复 2011-02-23 21:23:21
立即停止无意义的计算，把你的POSCAR放上来看看，应该是基矢有问题
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2楼2011-02-23 17:11:23
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hans201011

新虫 (小有名气)

POSCAR

引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-02-23 09:11:23:
立即停止无意义的计算，把你的POSCAR放上来看看，应该是基矢有问题

这是POSCAR
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3楼2011-02-23 17:34:03
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bingmou

金虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-02-23 21:23:34
为什么你建了一个非常奇怪的unit cell呢？但这个应该不是问题所在
你应该把cart改为direct
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4楼2011-02-23 17:41:44
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hans201011

新虫 (小有名气)

还是出现warning

引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-02-23 09:41:44:
为什么你建了一个非常奇怪的unit cell呢？但这个应该不是问题所在
你应该把cart改为direct

改成direct之后还是出现warning
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5楼2011-02-23 17:47:08
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bingmou

金虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1): 谢谢交流 2011-02-23 21:23:47
首先，我觉得不应该出错了。其次，为什么cellvolume is zero呢？
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-02-23 18:22:22
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢指点 2011-02-23 21:23:58
原子坐标有问题。即使将Carteisan---> Direct也是不行的。

HCP结构的Mg,按实验晶格常数a = 3.21 angstrom, c = 5.21 angstrom来写基矢的话，
简单的方式：
a
1.000000    0.000       0.000
-0.5           sqrt(3)/2    0.0000
0.000       0.0000       c/a

重新准备你的POSCAR。
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7楼2011-02-23 18:40:04
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hans201011

新虫 (小有名气)

前辈能不能再指点一下啊

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-02-23 18:40:04:
原子坐标有问题。即使将Carteisan---> Direct也是不行的。

HCP结构的Mg,按实验晶格常数a = 3.21 angstrom, c = 5.21 angstrom来写基矢的话，
简单的方式：
a
1.000000    0.000       0.000
-0.5      ...

我按照这个方式改完之后  还是出现warning
前辈能不能给个含有几十个原子的POSCAR啊
多谢了
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8楼2011-02-23 20:45:21
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢侯老师详细指教 2011-02-24 08:39:13
参看这里Mg, HCP结构的基矢和原胞内的原子坐标：
http://cst-www.nrl.navy.mil/lattice/struk/a3.html

在原胞的基础上将它扩展成2x2x3的超原胞就可以了。如下面的：

super cell
        3.2100000000
   2.000000000000000   0.000000000000000   0.000000000000000
  -1.000000000000000   1.732050807568877   0.000000000000000
   0.000000000000000   0.000000000000000   4.869150000000000
   24
Direct
   0.333333333333333   0.166666666666667   0.250000000000000
   0.833333333333333   0.166666666666667   0.250000000000000
   0.333333333333333   0.666666666666667   0.250000000000000
   0.833333333333333   0.666666666666667   0.250000000000000
   0.333333333333333   0.166666666666667   0.583333333333333
   0.833333333333333   0.166666666666667   0.583333333333333
   0.333333333333333   0.666666666666667   0.583333333333333
   0.833333333333333   0.666666666666667   0.583333333333333
   0.333333333333333   0.166666666666667   0.916666666666667
   0.833333333333333   0.166666666666667   0.916666666666667
   0.333333333333333   0.666666666666667   0.916666666666667
   0.833333333333333   0.666666666666667   0.916666666666667
   0.166666666666667   0.333333333333333   0.083333333333333
   0.666666666666667   0.333333333333333   0.083333333333333
   0.166666666666667   0.833333333333333   0.083333333333333
   0.666666666666667   0.833333333333333   0.083333333333333
   0.166666666666667   0.333333333333333   0.416666666666667
   0.666666666666667   0.333333333333333   0.416666666666667
   0.166666666666667   0.833333333333333   0.416666666666667
   0.666666666666667   0.833333333333333   0.416666666666667
   0.166666666666667   0.333333333333333   0.750000000000000
   0.666666666666667   0.333333333333333   0.750000000000000
   0.166666666666667   0.833333333333333   0.750000000000000
   0.666666666666667   0.833333333333333   0.750000000000000
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9楼2011-02-23 23:28:16
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hans201011

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-02-23 23:28:16:
参看这里Mg, HCP结构的基矢和原胞内的原子坐标：
http://cst-www.nrl.navy.mil/lattice/struk/a3.html

在原胞的基础上将它扩展成2x2x3的超原胞就可以了。如下面的：

super cell
        3.210 ...

在原胞的基础上将它扩展成2x2x3的超原胞就可以了
这句话怎么理解
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10楼2011-03-16 15:54:25
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