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hans201011

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】24个Mg原子,即hcp结构, 结果里面出现很大的warning,怎么回事已有5人参与

24个Mg原子,即hcp结构, 结果里面出现很大的warning,


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hans201011

新虫 (小有名气)

POSCAR

引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-02-23 09:11:23:
立即停止无意义的计算,把你的POSCAR放上来看看,应该是基矢有问题

这是POSCAR

3楼2011-02-23 17:34:03
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hans201011

新虫 (小有名气)

还是出现warning

引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2011-02-23 09:41:44:
为什么你建了一个非常奇怪的unit cell呢?但这个应该不是问题所在
你应该把cart改为direct

改成direct之后还是出现warning

5楼2011-02-23 17:47:08
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hans201011

新虫 (小有名气)

前辈能不能再指点一下啊

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-02-23 18:40:04:
原子坐标有问题。即使将Carteisan---> Direct也是不行的。

HCP结构的Mg,按实验晶格常数a = 3.21 angstrom, c = 5.21 angstrom来写基矢的话,
简单的方式:
a
1.000000    0.000       0.000
-0.5      ...

我按照这个方式改完之后  还是出现warning
前辈能不能给个含有几十个原子的POSCAR啊
多谢了
8楼2011-02-23 20:45:21
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hans201011

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-02-23 23:28:16:
参看这里Mg, HCP结构的基矢和原胞内的原子坐标:
http://cst-www.nrl.navy.mil/lattice/struk/a3.html

在原胞的基础上将它扩展成2x2x3的超原胞就可以了。如下面的:

super cell
        3.210 ...

在原胞的基础上将它扩展成2x2x3的超原胞就可以了
这句话怎么理解
10楼2011-03-16 15:54:25
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hans201011

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by uuv2010 at 2011-03-17 11:22:39:
Mg的原胞可以这样写:
Mg
    1.000000
    3.209400     0.000000     0.000000
   -1.604700     2.779422     0.000000
    0.000000     0.000000     5.210500
  2
Direct
    0.333333     0.66666 ...

单看这计算好的坐标  也看不出什么啊
能不能写几个没运算的  比如第一个是1/3
16楼2011-03-17 13:49:47
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hans201011

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by wujiandongde at 2011-03-17 12:52:09:
很明显 你的POSCAR有问题,有某几个原子在同一个位置上了 建议你重新写POSCAR

我也想重新写POSCAR啊  
老板让我算Mg hcp的 0001   110  111  221  ...  这些面的surface energy 怎么算啊
17楼2011-03-17 13:51:45
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hans201011

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by uuv2010 at 2011-03-17 11:22:39:
Mg的原胞可以这样写:
Mg
    1.000000
    3.209400     0.000000     0.000000
   -1.604700     2.779422     0.000000
    0.000000     0.000000     5.210500
  2
Direct
    0.333333     0.66666 ...

我简单看了一下书 写了一些原子坐标  帮我看看呗  因为我也不太知道你那个原子坐标怎么写出来的  z方向为什么不是c=5.21的倍数 然后为什么没有一个坐标大于1呢
Mg
   3.209
     1               0                0
     -0.5          0.8666         0
     0              0                c/a=0.3116

Direct
   0.0            0.0               0.0
   0.0            -1.0              0.0
   1.0            0.0               0.0
   1.0           1.0                0.0
   0.0           1.0                0.0
   -1.0          0.0                0.0
   -1.0          -1.0               0.0    #到这儿是第一层的7个原子
   0.6667      0.3333         c/2=2.605
   -0.3333    -0.6667         2.605
   -0.3333    -0.3333         2.605   #这是第二层的三个原子
                                                #第三层就是没个第一层的坐标加上个c



这是我看完书的理解程度了
19楼2011-03-18 14:40:32
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