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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【讨论】应该怎么设置力场
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memgr

铜虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】应该怎么设置力场

如果想用gromacs联合原子模拟一个聚合物的分子动力学，应该怎么设置聚合物的itp呢，大家有什么好的意见吗？或者提供文献参考一下，谢谢
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1楼 2011-02-23 14:58:13
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shengxiang

木虫 (著名写手)
memgr(金币+1): 2011-02-28 18:49:04
memgr(金币+1): 2011-07-13 15:05:33
粗粒化吗？
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2楼2011-02-25 10:49:32
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memgr

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by shengxiang at 2011-02-25 10:49:32:
粗粒化吗？

我是想先跑一下联合原子的，然后在跑一下粗粒的，以联合原子模拟的为标准，调节粗粒的参数，想问一下高手有什么高见吗？
赞一下 回复此楼
3楼2011-02-25 14:47:25
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1dubo

银虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-03-04 10:22:06
memgr(金币+1): 2011-07-13 15:05:40
用PRODRG吧！
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4楼2011-03-03 21:22:11
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