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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】X射线晶体衍射或NMR测得的大分子结构距离体内的真实结构到底有多远
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zpliu09

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】X射线晶体衍射或NMR测得的大分子结构距离体内的真实结构到底有多远 已有2人参与

我是研究蛋白质结构天然结构预测的，每天都要用到PDB里的蛋白建模，都是计算机上的模拟。我没有做过生物大分子结构测定，只知道目前主流的实验方法就是 X-Ray或者NMR。但是这个问题一直困扰着我，特向大家请教：用这两项实验手段测得的大分子结构数据距离体内的真实结构到底有多远？希望做过这方面的朋友能帮忙解惑！谢谢拉！
顺便给大家拜个年！

[ Last edited by zpliu09 on 2011-2-5 at 15:16 ]
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1楼 2011-02-05 15:04:19
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coconat008

铁虫 (小有名气)
★ ★
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1949stone(金币+1): 学习下 2011-06-09 10:12:00
个人认为X-RAY与真实结构还是有差距的，毕竟是在结晶条件下的构像。NMR在这方面是肯定有优势的，毕竟是在液态的情况下，但是现阶段分析不了太大的蛋白。
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彪憾的人生，无怨无悔
2楼2011-06-09 09:13:45
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dreamofyou

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
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1949stone(金币+2): 鼓励 2011-06-09 10:12:14
引用回帖:
Originally posted by coconat008 at 2011-06-09 09:13:45:
个人认为X-RAY与真实结构还是有差距的，毕竟是在结晶条件下的构像。NMR在这方面是肯定有优势的，毕竟是在液态的情况下，但是现阶段分析不了太大的蛋白。

我就是做蛋白结构的，这位同学说得很对～
NMR用于解析蛋白结构应用还是不是太多，蛋白的大小有限制，另外解析结构相当复杂。不像X－Ray现在已经满成熟了，软件什么的很方便，而且不受蛋白大小限制。
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3楼2011-06-09 10:10:12
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