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北斗星星

至尊木虫 (知名作家)

老版主

[交流] 【请教】X射线衍射确定化合物结构 已有5人参与

本人是学化学的,最近做了一个小分子化合物,因为取代基的位置不确定,想做个X射线衍射来确证一下,请问做X射线衍射对样品有什么要求,需要弄成多大多大的晶体吗?很小的晶体(近粉末状)可以吗?

恳请各位对我这个外行人普及一下X射线衍射的基本常识!谢谢!
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xujun16

银虫 (著名写手)

北斗星星(金币+2):谢谢 2010-12-02 20:11:09
引用回帖:
Originally posted by 北斗星星 at 2010-06-14 16:38:39:


我是化学合成方向的,至于由衍射结果推导具体结构(小分子,可能结构有两种,需确认是哪一种),可以让做这个工作的老师去做,还是人家只给你做个衍射,自己去解结构呢?弱弱的问,谢谢

一般只收集数据,因为解结构还是很有难度的!
9楼2010-06-14 21:29:06
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普通回帖

kfrog

铜虫 (初入文坛)


wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来 2010-06-13 23:27:40
北斗星星(金币+2):谢谢指点 2010-06-14 16:34:07
如果是要做单晶衍射的话,如果有0.05mm大小的就可以上机试试了。小晶体未必衍射会弱。保险起见的话,选择0.1-0.2mm。如果晶体本身衍射很弱的话,那就挑更大的吧。仪器的光源强度也是一个很重要的影响条件。如果你的化合物中没有重原子的话,比如说只含CHON,并且高角度衍射弱,那用Cu光源测试的效果会好很多。
2楼2010-06-13 22:50:28
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北斗星星

至尊木虫 (知名作家)

老版主

引用回帖:
Originally posted by kfrog at 2010-06-13 22:50:28:
如果是要做单晶衍射的话,如果有0.05mm大小的就可以上机试试了。小晶体未必衍射会弱。保险起见的话,选择0.1-0.2mm。如果晶体本身衍射很弱的话,那就挑更大的吧。仪器的光源强度也是一个很重要的影响条件。如果你 ...

我的应该有0.05mm大小,黄色小晶体,不知是否可以
大步向前
3楼2010-06-13 23:53:27
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kfrog

铜虫 (初入文坛)


yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-06-14 00:42:00
北斗星星(金币+2):谢谢 2010-12-02 20:11:23
算是很小的晶体了。如果上机测试方便的话,试试看。如果仪器光源比较弱的话,就不用抱太大希望了。不过拍一张照片就可以看到是否是粉晶了。还有就是低温下测试也可以使得晶体衍射能力增强。
4楼2010-06-14 00:22:49
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sigmax

银虫 (正式写手)

yanhualover:谢谢交流 2010-06-14 01:06:38
北斗星星(金币+1):谢谢 2010-12-02 20:10:52
取代基的位置不确定,可以用核磁、红外结合模拟来确定,不一定用衍射。粉末衍射可以用于确定结构,但是精度有多高、影响因素是什么还不清楚。一般是知道化学结构后求解晶体结构比较可行。当然,单晶衍射对于确定取代基位置就比较有力。
5楼2010-06-14 00:47:15
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北斗星星

至尊木虫 (知名作家)

老版主

引用回帖:
Originally posted by sigmax at 2010-06-14 00:47:15:
取代基的位置不确定,可以用核磁、红外结合模拟来确定,不一定用衍射。粉末衍射可以用于确定结构,但是精度有多高、影响因素是什么还不清楚。一般是知道化学结构后求解晶体结构比较可行。当然,单晶衍射对于确定取 ...

请教粉末衍射,单晶衍射二者有什么区别,我对这方面一点都不懂
大步向前
6楼2010-06-14 12:22:17
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xujun16

银虫 (著名写手)


北斗星星(金币+3):谢谢 2010-06-14 16:34:21
hyzjl1985(金币+1):谢谢交流 2010-06-14 18:20:01
引用回帖:
Originally posted by 北斗星星 at 2010-06-14 12:22:17:



请教粉末衍射,单晶衍射二者有什么区别,我对这方面一点都不懂

你好!
   粉末衍射和单晶衍射原理是一样的。
   在做法上有点差别:1.单晶得到的数据,(是一个三维的信息)应该结构模型就基本出来了!需要后续精修,加氢,无序处理等即可!(做法上较成熟)
     而粉晶(是一个一维的信息,将三维重叠为一维),则需要将原始数据处理,还是以结构为例,需要指标化,空间群推导,如果用直接法解析结构,还需要提取结构因子。如果用直接空间法,则要建立大致的结构,用模拟退火或遗传算法等,进行搜索可能的结构模型,以这样的方法得到相角,以得到结构(做法上较繁锁,但也很成熟)。然后再结构精修。
    总之,单晶和粉晶,原理是一样的,只是一个尺寸上的差别,所以导致了,数据处理上的差别。所以,当培养不出单晶的话,要想知道结构,只能利用粉晶的方法处理!
   希望有所帮助!有误之处,谢谢大家指正!
7楼2010-06-14 13:27:05
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北斗星星

至尊木虫 (知名作家)

老版主

引用回帖:
Originally posted by xujun16 at 2010-06-14 13:27:05:

你好!
   粉末衍射和单晶衍射原理是一样的。
   在做法上有点差别:1.单晶得到的数据,(是一个三维的信息)应该结构模型就基本出来了!需要后续精修,加氢,无序处理等即可!(做法上较成熟)
     而粉晶 ...

我是化学合成方向的,至于由衍射结果推导具体结构(小分子,可能结构有两种,需确认是哪一种),可以让做这个工作的老师去做,还是人家只给你做个衍射,自己去解结构呢?弱弱的问,谢谢
大步向前
8楼2010-06-14 16:38:39
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sigmax

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
如果是两个结构中分辨其中一个,那用粉末解晶体结构会比较容易一些。

前提,分子结构式已知,粉末衍射的最强峰计数在1万以上,高分辨扫描。你可以把结构发来看看。
10楼2010-12-02 21:01:02
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