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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】电子密度问题-如何回答评审人的问题？急啊
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sunday6392

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】电子密度问题-如何回答评审人的问题？急啊

第三个评审人的问题是：2. How the electronic density changes with diferent geometries and how the influence in the magnetic properties with that changes?
电子密度怎样随着不同的几何构型而变化
电子密度的变化又对异构体的磁性是如何影响的？

计算的体系是有机金属化合物（由gaussian03计算）
这里的电子密度如何理解？（应该不是自旋密度吧？）
请教各位 我应该怎么分析 给点建议
拜托大家了哈

祝大家假期快乐！
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1楼 2011-01-25 11:33:50
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sunday6392

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-01-25 14:36:06:
电子密度想来应还是通常意义的。

但如果把全分子或者去掉内层电子的价层电子的电子密度画出来，它们都是浓浓的一片云，很难具体比较几何构型变化在电子云上的变化。

只能作密度差。但是现在几何构型发生了变 ...

非常感谢您的建议
我感觉好像有些复杂化了
如果再简化些就好了

请周老师看一下下面这个图（J. Phys. Chem. A 2009, 113, 7097–7102）
这样是不是更明了些
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4楼2011-01-25 15:43:49
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zhou2009

版主 (著名写手)
sunday6392(金币+5): 谢谢周老师 2011-01-25 15:37:30
电子密度想来应还是通常意义的。

但如果把全分子或者去掉内层电子的价层电子的电子密度画出来，它们都是浓浓的一片云，很难具体比较几何构型变化在电子云上的变化。

只能作密度差。但是现在几何构型发生了变化，也不能直接来作密度差。
但可以作分子片的密度差，但因不知几何构型到底是如何在变化，不能提出具体的设想。

分子片的密度差，原则上可以这样作：在你的分子中，选择一个这样的关节键，划分分子为R-R’。 R分子片包含金属，R’ 分子片包含异构体的几何构型变化，最好R分子片在构型上没有什么变化，并且将它固定统一的坐标不变，以便比较。
分别计算第一种分子的R-R’的ρ、R的ρ和R’的ρ，要注意这时R和R’都形成有一个单电子的了。然后用R-R’的ρ逐次减去R的ρ和R’的ρ，就得到第一种构型分子的Δρ。
然后计算第二个分子的R-R’，同样作第二种构型分子的Δρ。
比较这两种分子Δρ的变化，特别是包含金属的R分子片的电荷变化，并与几何构型、磁性影响关联起来。
用GV除了看等值面图外，还要设计R在一个平面上，从而比较两个分子在R的截面等值线图，等值线图更加突显不同几何构型的电荷净变化。
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2楼2011-01-25 14:36:06
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manson1998

金虫 (著名写手)
u may get the result after finishing ur optimization first
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3楼2011-01-25 14:39:22
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zhou2009

版主 (著名写手)
图示只涉及到键长和电子密度的变化。
键长由gaussian03计算会在输出中给出。
电子密度，从它给出的单位看是一个指定点的。
它的得到可以这样作，由gaussian03计算得到chk文件，改写成fch之后，读入multiwfn程序，选择只对某一个指定点（指定x、y、z的坐标值）计算电子密度即可求得，它的表达单位与图例一致。
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5楼2011-01-25 18:27:04
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